在麾下兩員最得力的指揮官各自提出計劃後，腓力自己拿定了主意。帕爾馬應當得到來自義大利的陸上支援，儘管這支部隊的實力也許並不能完全達到他的要求。一旦時機閃現，他要帶領軍隊和駁船來到佛蘭德海岸做好一切準備。與此同時，聖克魯茲會在里斯本召集遠征艦隊，這是一支西班牙的無敵艦隊，它將負責對付英國海軍，並搭載和護送強大的西班牙步兵渡海。無敵艦隊將向英吉利海峽進發，劍指英格蘭。帕爾馬需要指揮部隊相機登上駁船，西班牙艦隊會順道與他在海上會合，並護送這些駁船抵達已經選定的登陸地點，那裡距離泰晤士河口不遠。等到堂阿爾瓦羅引領帕爾馬安全抵達英格蘭，並且把無敵艦隊自身從西班牙運來的步兵護送到岸，他還將站出來，繼續為帕爾馬確保海上運輸線的安全通暢。假如英國艦隊主動挑起戰鬥，或是我軍大舉進攻的良機出現，堂阿爾瓦羅還應積極參戰，主動摧毀敵人，不過無敵艦隊的首要職能仍然是運送大軍登陸。堂阿爾瓦羅是否充分理解了行動的要旨，我們無從得知，但帕爾馬顯然已將計劃牢記心中，一如堂博納蒂諾·德·門多薩至少在蘇格蘭的瑪麗離世前半年就已經全然明曉了自己的角色。
在某種程度上，這是個好計劃。雖然英國如果不能走向內部分裂，這樣一支外部入侵力量並不足以奪取全島，但這個計劃並不像帕爾馬的想法那樣，過度倚重英國的天主教徒。使用就駐紮在海峽對岸的帕爾馬的老兵渡海作戰，比起從西班牙一路運來整支入侵大軍要更加合算。（好像腓力能夠依照堂阿爾瓦羅的要求召集足夠的陸軍部隊，或是能夠找來充足的船隻運送他們似的！）而在陸上作戰時，運用帕爾馬舉世無雙的軍事技藝也是極為可取的。這個計劃並沒有置登陸後的帕爾馬於不顧，不至於讓他們在萬一失去運輸線、喪失撤退的可能後，陷於要麼全軍覆沒要麼必須孤注一擲徹底征服英格蘭的境地。而且，通過減少和簡化艦隊的職能，或許可以期望海軍東拼西湊出來的物資是夠用的。這當然也是個複雜而又嚴苛的計劃，沒有為錯誤或是突發事故預留太多空間，但別無他法的腓力仍然決定信賴指揮官們的技藝和忠誠。
開弓沒有回頭箭，不過就最初的情況來看，西班牙的戰前準備仍然籠罩在將信將疑的試探性氣氛中。大批合同被承包出去，涉及數量可觀的餅乾、魚乾、帆布和索具。新的步兵連隊正在組建，舊有的連隊則要補充滿員。在德意志和義大利，國王的代理人正在找尋海軍軍械，首選加農炮和長重炮等重型火炮，但最終放寬至比輕武器大不了多少的小型火炮，凡是能被搬運到船舶上的銅炮或鐵炮，都被他們悉數帶回。安達盧西亞supsmallid="filepos277155"/small/sup和比斯開灣的各個港口擠滿了五花八門的船舶，它們來自拉古薩、那不勒斯、熱那亞、法國、丹麥和漢薩同盟supsmallid="filepos277385"/small/sup的訂約城市，這些艦船或被租用，或被強行徵調，將要為最後的決戰服務。在里斯本，新造的蓋倫帆船裝上了桅杆，舊艦船也已修繕完畢，雖然它們多數仍然只是一具空殼，既沒有火炮，也缺少船員。海岸上的熱火朝天顯然在預示正發生著什麼，不過截至當時，那種場面還沒有緊迫到與即將和英格蘭展開生死之戰相吻合的程度。那年春天駐留馬德里的義大利大使們，包括一名威尼斯人、一名熱那亞人、一名佛羅倫薩人、一名曼圖亞人以及兩位教皇派來的代表，在談起眼前的一切是否與針對英格蘭的戰前準備有關時，也都沒有十足的把握。
或許腓力自己也還沒有下定決心。一方面，英國人的挑釁已經讓他忍無可忍：德雷克在厚顏無恥地劫掠西班牙沿海和西印度群島，萊斯特的軍隊仍然屯駐在尼德蘭，英國天主教徒的處境也在不斷惡化，對於最後這一點，自從在英格蘭締結姻緣supsmallid="filepos278555"/small/sup以後，腓力便自感負有施以援手的特別義務。教皇勸告他當機立斷，英國流亡者們乞求他加快日程，在朝堂之上，主戰派也日益佔據上風。唯一讓腓力舉棋不定的原因也許還在於自己，正如他曾寫下的那則信條：越是波瀾萬狀，就越要踟躕慎行。
另一方面，圍繞計劃的確仍有許多事端在牽絆腓力。首先面臨的便是經費問題。窮盡墨西哥和秘魯的白銀，仍然不能將他從日漸深陷的債務泥潭中解救出來，年復一年，他只好不斷將部分稅收抵押出去，借款一旦擲入尼德蘭戰場，就像擲入無底洞一樣杳無聲響，他卻要為此償付越來越高的利息。葡萄牙曾經神話般地壟斷了霍爾木茲和印度的全部財富，現在卻和西班牙一樣瀕臨破產的邊緣，甚至處境更糟。而腓力知道，比起陸軍，海軍的開支有過之而無不及。
比經費問題還要糟糕的是事態的不確定性。任何一場戰爭都是一次冒險，在審慎之人眼中都是不受歡迎的。腓力熱衷於想象這樣的自己，他從未主動尋求戰爭，他只是為了防禦而開戰，他從不濫用力量去劫掠或者壓迫鄰居。「他害怕戰爭，」帕森斯神父曾經這樣輕蔑地描繪腓力，「就像曾經被火灼傷的孩子害怕火焰。」他尤其害怕與英格蘭作戰。對於這個自己曾任國王的國度，他委實有所瞭解，他知道這項計劃或者任何與此相關的其他安排，都將是孤注一擲的賭博。不止一次，面對那些宣稱征服英格蘭輕而易舉的檔案，他都以潦草的筆跡在頁邊批註了一個簡略的詞彙——「胡言！」在早先的歲月裡，當他仍然是瑪麗的丈夫時，他曾寫下：「英格蘭王國現在和未來都必須保持海上力量的強大，社稷安危全然仰賴於此。」而今英格蘭依舊是海上強國，最富有經驗的船長們也都會提醒他，挑戰對方不可能毫無風險。
曾有一度，該計劃看上去如若取得成功甚至將比失敗更加危險。假如他的軍隊推翻了英格蘭，而瑪麗·斯圖亞特還活著，那麼蘇格蘭女王必將登上英格蘭的王座。沒錯，她至少是天主教徒。近來她還對自己大獻殷勤，也許成為女王后，她會一如既往地對西班牙感恩戴德。但是她的心終究屬於法蘭西，腓力早就從先父那裡懂得了一個道理，對於本國最大的威脅莫過於法國和英格蘭的聯合。如果西班牙人犧牲了鮮血和財富，只換得法國國王再次成為歐洲最強大的君主，那真是苦澀的諷刺。對於在英格蘭恢復正統信仰的努力，上帝難道竟要索取如此高昂的代價嗎？
至少這種風險現在已不復存在。我們不能確定這對腓力有怎樣的影響，我們也無從得知，在面對門多薩的來信苦思冥想時，他又懷有怎樣的想法。我們只知道在一連多日沒有觸碰紙筆，秘書們也閒於無事之後，3月31日夜，從埃斯科里亞爾修道院那處宛如心房的神秘幽室裡突然傳來了律動。一批簡短有力的公文被同時派發出去。聖克魯茲必須在春天結束前做好起航的準備。卡塔赫納、馬拉加的船隻和貨物務必立刻抵達里斯本。比斯開灣的造船工人可以預先支取他們要求的2.5萬埃斯庫多supsmallid="filepos282243"/small/sup，唯一的條件是加緊工期！巴塞羅那的海軍兵工廠要複查庫存的軍械和貨品，調動一切閒置物資，為大西洋上的無敵艦隊提供裝備。另一封內容與此相似的公文發往了那不勒斯。給熱那亞的信函則用強調的語氣責問硝石未能按期送達的原因。致帕爾馬的函件簡潔而含蓄地表達瞭如下大意：鑑於近來的諸般事體，早先商定的計劃將會加速實施。門多薩也收到了同樣簡短的信函。他將前去會見蘇格蘭駐法國大使，弔唁女王之死。門多薩沒有得到關於其他事項的新的指示，他可以由此認為自己的建議獲得了認可。
同一天晚上，另一批鼓鼓囊囊的信件也得以起草，它們將被送去羅馬，措辭要直白得多。腓力從未忘記，寄給帕爾馬和門多薩的信函有可能被胡格諾教徒截獲，對這些人來說，封印沒有任何神聖意味，也沒有什麼密碼永遠安全。但寄往羅馬的包裹則不必擔此風險。因此，除了向紅衣主教卡拉法致以熱情問候，他還就一系列行動向威廉·艾倫做出了詳細說明，並對艾倫此前在信函中表達的恭順故作不知，最後，腓力還擬就了一批將要交給奧利瓦雷斯的函件和文書。奧利瓦雷斯將再次為及早拿到借款而奔走。他要提醒教皇，法國國王不值得信任。他還將把支援腓力繼承英國王冠的所有檔案獻給教皇，爭取說服教皇為腓力秘密舉辦一場簡短的授職禮。當然，腓力會把王位移交給自己的女兒。他對於獲得新的王國並不感興趣。只是由於蘇格蘭女王被殘忍處死，他才比以往更加急切地想要推動這項事業的發展。
此外還有另一封信函，它顯然將被呈遞給羅馬教廷。「［對於瑪麗之死］我深感悲痛，」腓力寫道，「因為她本來會是領導那些國度［英格蘭和蘇格蘭］重歸天主教信仰的最適宜人選。但既然上帝以其智慧另作安排，那麼他必然將會挑揀新的人選，促成神聖事業的最終勝利。」以上這些可以視為腓力獨自沉思的結果。腓力由此獲得了迎接未來諸多試煉的力量，在換作其他任何人都可能畏縮不前的時刻，腓力徑直前行，好似被異象指引，儼如一名夢遊者。當他終於做出抉擇後，他的目光或許會再次停留在門多薩來函中的一段話上：「因為上帝的顯豁意旨已然眾目昭彰，他將把這兩個王國的王冠全都授予陛下。」
前任神聖羅馬帝國皇帝查理五世在1556年退位後，他的弟弟費迪南一世繼承了皇帝稱號，他的兒子西班牙國王腓力二世雖然沒能得到帝號，卻繼承了哈布斯堡帝國除奧地利、德意志之外的其餘所有版圖。
1580年，葡萄牙國王紅衣主教「純潔者」恩裡克一世去世，沒有指定王位繼承人。在他死後，克拉圖的堂安東尼奧和西班牙腓力二世等幾人都聲稱有王位繼承權。1580年7月19日，堂安東尼奧在聖塔倫宣稱繼位，但沒有多久就被西班牙的軍隊打敗，趕出葡萄牙。之後他試圖在亞速爾群島的特塞拉島統治葡萄牙，在那裡建立了反對派政府。1581年，他在逃亡法國期間受到凱瑟琳·德·美第奇的熱情款待，她將他視為自己反對腓力二世的工具，在許諾付出一定的條件後，堂安東尼奧獲得了一支由葡萄牙流亡者和法、英冒險者組成的艦隊。1582年7月26、27日，聖克魯茲侯爵率領一支西班牙-葡萄牙聯合艦隊在亞速爾群島擊敗了堂安東尼奧的艦隊，後者的反對派政府於1583年瓦解。
堂阿爾瓦羅·德·巴贊即聖克魯茲侯爵。
安達盧西亞（andalusia），西班牙最南部的古稱。
13至17世紀北海、波羅的海沿岸城鎮組成的商業、政治同盟。
1554年，腓力二世曾與前任英格蘭女王瑪麗·都鐸成婚，腓力名義上擁有英格蘭國王的稱號。
埃斯庫多（escudo），舊時西班牙貨幣單位。