1990年起擔任國家領導人的卡里莫夫和本國國民的想法一樣。許多烏茲別克人認為「棉花案」是一種政治迫害，卡里莫夫也是這麼想的。1991年9月，卡里莫夫主持召開烏茲別克共產黨代表大會（烏茲別克共產黨後更名為人民民主黨），大會通過的決議免除了烏茲別克共產黨領導人的一切罪責。決議寫道：「他們為了祖國的福祉，誠實地工作，問心無愧，他們可以直接而坦誠地望著他的人民。「1991年12月底，在卡里莫夫即將被選為烏茲別克新任總統的前幾日，他請求每一位在調查中遭到迫害的人民的原諒。在那時，「棉花案」已經成為眾所周知的「烏茲別克貪腐大案」，這個案件成了烏茲別克人遭到共產主義政權迫害的象徵。
在戈爾巴喬夫推動的新聯盟條約談判期間，卡里莫夫比納扎爾巴耶夫表現得更傾向於獨立。他常與葉利欽和克拉夫丘克一起，使戈爾巴喬夫企圖把各個共和國更緊密地團結於蘇聯中央的努力受挫（納扎爾巴耶夫通常支援戈爾巴喬夫）。8月政變之後，他迅速地摘掉了烏茲別克社會共產主義信仰的面具，拆毀了共產黨領導人的紀念碑，把原先以他們的名字命名的廣場和街道更名。可是，他宣佈烏茲別克還沒有做好民主化的準備，他鎮壓了初生的反對力量。儘管他的舉動偏離了莫斯科方面的意志，可是別洛韋日發生的事情還是讓他很不高興。針對斯拉夫國家總統間單獨簽訂的協議，他後來直接向葉利欽表達自己的不滿。但是，1991年12月12日和13日在阿什哈巴德進行的漫長討論中，卡里莫夫支援納扎爾巴耶夫還有其他一些人，他們都反對訂立莫斯科記者早前稱為的《穆斯林憲章》。
卡里莫夫加入獨聯體的動機和納扎爾巴耶夫可不一樣。和吉爾吉斯斯坦的總統阿卡耶夫一樣，卡里莫夫需要俄羅斯和獨聯體作為盟友，以此對抗伊斯蘭原教旨主義。還有他更需要俄羅斯的紡織廠生產加工烏茲別克的棉花。沒有這些的話，烏茲別克的經濟將在數週內崩潰。卡里莫夫在阿什哈巴德會議結束後和記者進行了交談，他拒絕在斯拉夫國家的聯合體中享受穆斯林共和國的二等公民的待遇。他告訴記者：「那些共和國要想逃脫二等公民的地位，唯一的出路是把中亞變成一個擁有自己的加工業的高度發達的地區。」
雖然他們對只有斯拉夫國家參加的別洛韋日會議感到不滿，但是納扎爾巴耶夫、卡里莫夫及其各自的幕僚們都發現，他們因為政治、經濟、社會、種族和安全等這樣或那樣的原因，除了支援俄羅斯和其斯拉夫鄰國在比亞沃維耶扎提出的協議外別無選擇。在阿什哈巴德，中亞國家領導人不僅同意加入獨聯體，而且還想出了一種挽救顏面的做法。會議結束後，納扎爾巴耶夫對記者說：「經過大家的協商，我們五國領導人通過了一份宣言。我們理解白俄羅斯、俄羅斯和烏克蘭共和國的領導人成立獨立國家聯合體以取代原來被剝奪公權的共和國聯盟的做法以及為之付出的努力。我們的主要條件是：所有加入獨聯體的國家都是其建立國，即享有絕對平等的權利。」
正如許多人所預期的那樣，將於12月21日召開的阿拉木圖會議，將要決定的不僅是瀕臨垮臺的蘇聯的命運，還將決定尚未完全確立的獨聯體的命運。此次會議將在哈薩克首都的友誼宮召開，正是在這裡，12位共和國領導人在11月初召開了沒有戈爾巴喬夫參加的首次峰會，並且簽署了一項經濟協議。
這次會議也將在戈爾巴喬夫缺席的情況下召開。但是，直到最後一刻才能清楚究竟有多少領導人將前往阿拉木圖參加這次會議。約500名記者趕到了哈薩克的首都報道這次會議，這將是共和國領導人參加的最後一次蘇聯會議，同時也是第一次後蘇聯峰會。記者們眾說紛紜。莫斯科《訊息報》的一位記者寫道：「現在，參加會談的不只是8國，而是9國或10國。亞美尼亞或者摩爾多瓦將加入明斯克的‘三國組合’和阿什哈巴德的‘五國組合’。」會議召開的前夜，有訊息稱亞塞拜然總統阿亞茲·穆塔利博夫也在趕往阿拉木圖的路中，亞塞拜然和亞美尼亞為了爭奪納戈爾諾——卡拉巴赫地區展開過血腥戰鬥。
人們紛紛猜測：這些代表不同利益的，有時甚至彼此開戰（例如亞美尼亞和亞塞拜然）的共和國領導人，坐到談判桌前會發生些什麼，應該期待這次會議達成哪些成果呢？唯一公開阿拉木圖峰會議程的政治領袖是未被邀請參加此次會議的戈爾巴喬夫。他沒有什麼辦法，只能發表公開宣告，闡述自己的觀點，試圖以此影響峰會的結果。俄羅斯議會通過《別洛韋日協議》以及中亞共和國領導人發表了阿什哈巴德宣告後，戈爾巴喬夫除了作出妥協同意成立獨聯體外，已別無選擇了。12月17日，就在這天貝克離開了莫斯科，戈爾巴喬夫就權力交接事宜和葉利欽召開了至關重要的會議，蘇聯總統向媒體承認，他的總統職位的作用和葉利欽的作用80%是重合的。
戈爾巴喬夫還在試圖發揮剩下的20%的作用，在第二天他向阿拉木圖峰會參與者致一封公開信。戈爾巴喬夫希望獨聯體成為國際法主體，參加到國際關係中，其公民擁有共同的身份。他還力主建立統一的軍事指揮，創立統一的外交機構，用以維護蘇聯海外合法的權利，以及蘇聯在聯合國安理會的代表權。他還建議成立負責協調經濟和金融政策以及學術和文化活動的獨聯體機構。最後，他提議把「獨立國家」的字樣從新組織的名稱中去掉，將它稱為「歐洲和亞洲國家聯合體」。
這封信使人們相信戈爾巴喬夫儘管接受了「聯合體」這個說法，可是，他實際上想要重建一個在已經破產的聯盟條約中所預想的那種更為鬆散的體制。實在不成，他準備同意葉利欽和納扎爾巴耶夫提出的，克拉夫丘克在8月政變失敗後也曾短暫接受的邦聯制原則。但是，一切為時已晚：邦聯制的列車早已駛出了車站，成了過眼煙雲。公開信的內容是切爾尼亞耶夫起草的，與沙赫納羅扎夫起草的宣告書相比，戈爾巴喬夫更喜歡前者。據切爾尼亞耶夫所言，沙赫納羅扎夫起草的文稿中，「完全是‘建設性’的語氣——仁慈的、和解的和祝福成功的」。是不是戈爾巴喬夫只在乎闡述自己的原則，而不去管政治結果呢？還是他仍然希望在獨聯體中扮演一個重要角色，使自己在政治上還能有所作為？在回憶錄中，戈爾巴喬夫沒有說明自己的想法，只是苦澀地談起——「不管怎樣，他的信已經無濟於事了。」
就在戈爾巴喬夫發表公開信的第二天，俄羅斯報紙發表了一篇葉利欽接受義大利《共和報》訪談的譯文，這篇文章使戈爾巴喬夫的政治前景更為暗淡。針對記者的提問：「戈爾巴喬夫將在獨聯體中擔任某個角色嗎？」俄羅斯總統的回答直截了當：「不。我們仍會尊敬他，維護他的尊嚴，這是他應得的。但是，我們已經決定在12月底之前完成交接，他也要在最後期限到來之前作出決定。」
葉利欽對於獨聯體機構的設想比戈爾巴喬夫的想法更為謹慎。他的首席助手布林布利斯在12月18日俄羅斯內閣就阿拉木圖峰會事宜進行磋商討論後，概括了葉利欽迫切想要的東西：「或許是元首理事會、政府首腦理事會和防務委員會。」就在這天，政府收到了幾份新俄聯邦國徽的設計方案。設計方案決定採用俄羅斯帝國時代的象徵——雙頭鷹。布林布利斯告訴媒體，在送交大會討論的兩份設計方案中，部長們決定選擇看上去威脅性沒那麼強的鷹的圖案。俄羅斯人最後要考慮的，就是不要嚇跑自己在獨聯體內潛在的夥伴國。
獨聯體新機構的屬性及其職權範圍讓烏克蘭的克拉夫丘克深感憂慮，以至一度不清楚他是否能參加阿拉木圖峰會。在別洛韋日會議上，克拉夫丘克曾堅持說，烏克蘭不會接受任何將限制其獨立的獨聯體機構。那天，他做到了。現在，這樣的安排突然受到了質疑：從葉利欽助手的講話可以看出來，俄羅斯渴望獨聯體各國之間「加深」交往，減少隔離。可是，克拉夫丘克不高興了。他遭到了來自政府、議會和社會各方面的強烈反對，以至於許多人認為他這麼做出賣了國家利益，在國家剛剛贏得了長久渴望的獨立後，他隨即這麼做是一種犯罪。這些帶領自己國家獲得了獨立的前共產黨官員，在尚未和內閣及議會展開充分磋商的情況下，就簽署了這份看上去好像重塑蘇聯的協議，他們這麼做到底有什麼企圖，許多人對此感到懷疑。
《別洛韋日協議》簽署後，一項在莫斯科、基輔和明斯克展開的民調顯示，在基輔，只有50%的受訪者表示贊成該協議的簽署，而在莫斯科和明斯克，該數字分別是84%和74%。贊成成立獨聯體的基輔民眾主要是從經濟角度出發，而不是三個斯拉夫國家組成一個政治統一體的概念使他們受到了鼓舞。根據基輔的民意調查，54%的受訪者把獨聯體的成立和更好的經濟前景結合在一起，而在莫斯科和明斯克，這一數字則是38%和44%。
在中亞總統建議取消原來的條約、簽署一份新條約後，克拉夫丘克表明，他並不急著去阿拉木圖。他一貫如此，善於放低姿態，以柔制勝。克拉夫丘克表示自己沒興趣再討論什麼新條約，他這麼做讓大家都深感不安。如果說中亞共和國不希望失去俄羅斯的話，那麼俄羅斯也不願失去烏克蘭。葉利欽曾反對在沒有烏克蘭的情況下，簽署戈爾巴喬夫的聯盟條約，因為這麼一來，就只剩下俄羅斯和中亞穆斯林國家的「一對一」的關係了。所以，葉利欽認為沒有烏克蘭的獨聯體也不成立。12月18日，貝克在基輔會見了克拉夫丘克，談話剛開始時克拉夫丘克請求美國支援烏克蘭獨立。當克拉夫丘克告訴貝克，他會前往阿拉木圖時，美國國務卿才深深地鬆了一口氣。
白俄羅斯領導人舒什克維奇和克拉夫丘克可不一樣，他急於參加阿拉木圖會議。在簽署了《別洛韋日協議》後，他很快發表了一則宣告，大意是說，獨聯體不是隻有斯拉夫國家參加的俱樂部，它是向其他國家敞開的，中亞國家也可以加入。但是，白俄羅斯人可不想不計代價地擴充獨聯體。他們的想法是：只有沒捲入暴力衝突的共和國才可以被邀請參加獨聯體。這樣的話，有些國家就被自動排除在外了：摩爾多瓦共和國，努力控制斯拉夫人佔主導地位的德涅斯特河沿岸地區；亞塞拜然共和國，努力想讓亞美尼亞居民佔主體的納戈爾諾——卡拉巴赫地區屬於自己的國家；亞美尼亞共和國，也捲入了卡拉巴赫衝突；或許還包括喬治亞共和國，該國反對派和政府軍發生了巷戰，因為在阿布哈茲和北奧塞梯地區，非喬治亞人佔據大多數，他們要求自決權。理論上講，如果在阿拉木圖峰會通過了白俄羅斯人的建議，那麼俄羅斯因為車臣危機的加劇，也應被禁止加入獨聯體。
與白俄羅斯人的建議大相徑庭的是，阿拉木圖會議必須對分裂勢力保持堅定的立場。隨著阿拉木圖會議召開日期的臨近，兩個分裂地區——摩爾多瓦的德涅斯特河沿岸和亞塞拜然的納戈爾諾——卡拉巴赫地區要搶在它們的「本國」之前，申請加入獨聯體。與此同時，俄羅斯承認按照蘇聯時期邊界劃分的摩爾多瓦和亞美尼亞共和國獨立。這麼做並不能緩解分裂地區的緊張局勢。1990年至1991年間，戈爾巴喬夫領導下的中央曾大力支援這些自治區背叛自己的「母國」，現在，在蘇聯走向崩潰的最後時刻，這些反抗活動也進行得「如火如荼」。
正如人們可以預見的那樣，蘇聯共和國早前都遇到了自治運動的困擾，所以，在別洛韋日會議上，俄羅斯、烏克蘭和白俄羅斯的總統都宣佈，他們支援各個共和國的「合法」當局。按照俄羅斯的提議，他們簽署了一份宣告，支援摩爾多瓦領導層鎮壓德涅斯特河沿岸的斯拉夫分裂勢力。3位斯拉夫總統強調各國現存的領土不容侵犯，並且要在法律框架下處理斯拉夫人的民族問題。他們在這些問題上的一致意見是為了防止出現一個「擁有核武器的南斯拉夫」，在戈爾巴喬夫末日預言中，曾經這麼形容蘇聯。
儘管3個斯拉夫共和國能和平共處，可是其他國家就做不到了。在非斯拉夫地區，種族之間的戰爭正愈演愈烈，蘇聯的軍隊也捲入了衝突之中。12月9日，《別洛韋日協議》簽署後的第二天，摩爾多瓦的軍隊在邊境城市本德爾與德涅斯特河沿岸的民兵組織展開交戰。德涅斯特河沿岸的武裝力量得到了形式上仍由戈爾巴喬夫領導的蘇聯第十四軍的支援。在接下來的數日中，德涅斯特河沿岸城市杜博薩雷爆發衝突。在亞塞拜然，總統穆塔利博夫在12月18日接管了共和國境內的全部軍隊。他希望蘇聯軍隊要麼接受他的指揮，要麼撤出亞塞拜然。第二天，納戈爾諾——卡拉巴赫地區的亞美尼亞人成立了自己的國防委員會，主要指揮當地民兵組織，同時和戈爾巴喬夫領導下的蘇聯軍隊展開合作。亞美尼亞總統彼得羅相簽署了一項法令，加強亞美尼亞當局和共和國境內的蘇聯軍隊的關係。雖然亞塞拜然人把本國境內的蘇聯軍隊視為潛在敵人，但是亞美尼亞人卻把他們當作盟友。
戈爾巴喬夫在烏克蘭全民公投前曾經就可能發生內戰而提出警告，然而內戰卻在其他共和國爆發了。戰爭一時間還僅限於高加索地區和摩爾多瓦的斯拉夫——羅馬邊地。不久，戰爭將蔓延至塔吉克。
12月21日上午11點30分，阿拉木圖峰會在哈薩克首都的友誼宮中如期舉行。原來蘇聯時期各國人民的友誼，將被參會者賦予新的含義。他們做到了。他們都面臨著國內外的諸多問題，但是他們希望這場自政變失敗以來最大規模的會議能夠展示前蘇聯共和國有能力擺脫數月以來的困境。
獨聯體會議的召開給共和國領導人提供了一個急需的協商平臺，而戈爾巴喬夫和他所召集的有關新聯盟協議的會議卻未能做到這一點。沙波什尼科夫元帥最先看清這一事實，他在回憶錄中寫道：「這是前蘇聯共和國首腦在數月中第一次這麼齊刷刷地聚在一起開會，事實上，除了波羅的海三國和喬治亞領導人以外——喬治亞領導人派來了一位觀察員，參會的每個人都言之切切。在蘇聯國務院召開的會議和在新奧加廖沃府邸進行的多次磋商中，總有些領導人由於各種原因未能參會，我將這幾次會議進行了對比。」
沙波什尼科夫形式上雖然是戈爾巴喬夫政府的一位部長，但是他擁有獨聯體自建立以來唯一的正式官方職位——獨聯體的軍隊總司令。沙波什尼科夫在《別洛韋日協議》簽訂後，立即接受了葉利欽的任命，現在沙波什尼科夫掌控著一支即將被分割的軍隊。北高加索地區的亞塞拜然、亞美尼亞和喬治亞共和國的總統都試圖控制本國境內的蘇聯軍隊，而位於德涅斯特河沿岸和納戈爾諾——卡拉巴赫分裂地區的領導人也在自己的管轄範圍內做著同樣的事，然而，沙波什尼科夫所遇到的問題並不止這些。
烏克蘭迄今為止還平安無事，可是該國的總統克拉夫丘克宣佈，他本人將擔任駐紮在烏克蘭境內的蘇軍總司令，這一決定對於維護軍隊統一所構成的威脅並不比其他共和國小。12月6日，沙波什尼科夫從前的門生、現在擔任烏克蘭國防部長的莫羅佐夫已經宣誓效忠於烏克蘭。為了應對沙波什尼科夫即將命令蘇聯軍隊宣誓效忠於俄羅斯，克拉夫丘克已經按計劃讓駐紮在烏克蘭境內的軍隊宣誓忠誠於烏克蘭。這些計劃曾一度被擱置，但是沙波什尼科夫希望烏克蘭人能在阿拉木圖的會上提出問題。令人驚歎的是，他們沒這麼做。
阿拉木圖會議的參會者主要關注兩項重大議題：蘇聯的解體和新獨聯體的成立，新獨聯體將包括11個共和國，而不是3個。後蘇聯共和國的首腦們僅用了3個半小時就達成了這個新的國際組織的原則，該組織將包括波羅的海三國以外的後蘇聯大多數共和國。截至下午3點，檔案定稿已經交付給打字員了，兩小時後，舉行了正式的簽約儀式。在中亞各位共和國領導的堅持下，包括俄羅斯、烏克蘭和白俄羅斯在內，後蘇聯時期的各個共和國領導重新簽署了獨聯體成立宣言。現在，所有參加阿拉木圖會議的共和國都是獨聯體的創始成員國。
俄羅斯代表團提出的大多數建議都得被採納。首先，各位總統同意成立兩個協調機構：國家元首理事會和政府首腦理事會。他們也同意廢除現存所有的蘇聯部委和機構，這項決定對於葉利欽在今後和戈爾巴喬夫的鬥爭具有至關重要的作用。同時與會各方還同意宣佈俄羅斯是蘇聯的繼承者，這尤指俄羅斯將繼承蘇聯在聯合國安理會中常任理事國的位置。此外，各方就聯合控制核武器所達成的協議與葉利欽數日前在莫斯科向貝克所說的內容完全一致。只有俄羅斯總統有權啟用核武器，其他擁有核武器國家的總統可以與之協商，但是沒有掌控發動核攻擊的技術能力。在1992年7月前，出於戰術安排，佈置在烏克蘭、白俄羅斯和哈薩克的核武器將被運至莫斯科，然後對其拆解、銷燬。包括克拉夫丘克、納扎爾巴耶夫和舒什克維奇在內的4位擁有核武器的國家領導人一致同意上述決定。
此次峰會大獲成功，因為會議只討論了各方都能同意的議題。其他內容將於12月30日在白俄羅斯首都，也是獨聯體首都明斯克召開的會議上再進行商討。在所有參會者中，最心存疑惑、態度保守的克拉夫丘克也與大家達成一致了。他同意讓沙波什尼科夫暫時掌管包括核武器和常規武器在內的所有軍隊，直到下一次峰會召開，不再堅持組建獨立的烏克蘭軍隊。此外，他也不反對俄羅斯成為蘇聯合法的國際繼承國，這意味著烏克蘭將喪失分配蘇聯海外資產的權力。
阿拉木圖協議也給了烏克蘭一些補償，蘇聯作為國際法的主體隨即解散了，這樣一來，也就為那些尚在騎牆觀望的美國和西方各國承認烏克蘭獨立掃平了道路。對於烏克蘭代表團來說，最重要的是，儘管有戈爾巴喬夫的堅持，可是阿拉木圖會議還是沒有成立超越於國家之上的機構，也沒有通過統一的獨聯體公民身份來侵犯烏克蘭的主權。此外，在別洛韋日特別成立的獨聯體國防委員會，唯一目的就是任命沙波什尼科夫擔任總司令，以此吸引他離開戈爾巴喬夫，現在被心照不宣地從協議上刪除了。克拉夫丘克事後滿意地回憶起這次峰會，他說在會議結束後召開的記者招待會上，大會的主人納扎爾巴耶夫「情緒平和地起身，有條不紊地宣佈了我們各方做出的決定：蘇聯不復存在了，獨聯體的成立已是事實，現在我們將致力於構建新的關係」。
貝克在乘坐美國飛機飛往華盛頓的途中，在大西洋上空，他接到了遙遠的阿拉木圖打來的電話。納扎爾巴耶夫給美國國務卿打電話，通報了剛才會議的結果。他對貝克說：「阿拉木圖會議結束了。11個共和國參加了會議，俄羅斯、烏克蘭、白俄羅斯和哈薩克決定統一管控他們的核武器。戰略性核武器很快將被運往俄羅斯，其餘擁有核武器的國家在10年內將成為無核國家。」
貝克簡直喜不自禁，他對哈薩克總統說：「我十分感激你打電話給我，你說得很全面。這與你我和其他共和國領導人討論的結果完全一致。」納扎爾巴耶夫感謝了貝克，但是他也強調這份成果來之不易。貝克回答：「你已經做得非常好了。」他向這位前共產黨領袖承諾，美國將很快承認哈薩克獨立。
莫斯科《訊息報》寫道：「時間將決定阿拉木圖協議的真正意義。」如果說，此次會議所具有的長遠的重要性對於參會者和觀察員來說尚不清楚的話，可是，對於有些人，當下的政治前途就係於這次會議的結果。第二天，戈爾巴喬夫的助手切爾尼亞耶夫在日記中寫道：「昨天是阿拉木圖屠殺日。很明顯，和1917年10月25日相比，這將是一個轉折點，有著同樣不確定的後果。」切爾尼亞耶夫指的是74年前布林什維克攻佔聖彼得堡市，該事件改寫了俄國的命運，也改變了世界的歷史。他和自己的上司戈爾巴喬夫將步入政治生涯最後的、或是最富有轉折性的階段，倘若不是悲劇階段的話。