站在旁邊的宦官黃錦卻不緊不慢地說：陛下放心！此人素有痴名，早已買好棺材，與家人訣別，不會逃跑的。
嘉靖聽罷，一聲長嘆，又撿起奏本一讀再讀。
黃錦所說半真半假。上疏之後，海瑞確實拿了二十兩銀子請一位同鄉安排後事，然後從容不迫地赴朝房待罪。別人都替他擔心，他卻神情自若，談笑風生，批評朝中大臣有如甘草。不過，當時海瑞的家眷在海南，訣別家人云雲多半是道聽途說，甚至是黃錦變相地替他求情。事實上海瑞的直言不諱讓許多人肅然起敬，以至於朝野轟動，舉世矚目，上自九重，下及薄海，內外無不知有所謂海主事者。sup/sup
現在輪到皇帝糾結了。
嘉靖很清楚，海瑞所言句句是實，只是從來沒有人敢在他面前說過一星半點。因此震怒之餘竟有些感動，覺得真正的忠臣就該如此。何況海瑞對他的天賦並不懷疑，反倒認為在漢文帝之上，只要幡然悔悟便可盡洗積弊，直追堯舜。
這番話說得嘉靖心潮澎湃，差點就要全盤接受。但他又對首輔徐階表示，自己老邁年高身體不好，因此就算想改也無能為力。實際上皇帝最為糾結的是，如果同意海瑞，就得承認自己既是昏君，又是暴君。這當然萬萬不可，他也只能不斷地自言自語：此人算得上比干，朕卻不是殷紂王。
海瑞的奏疏，也一放就是數月。
到了次年二月，越想越氣的皇帝終於下令，將海瑞關進詔獄，後來又移到刑部的牢房。但是，儘管嘉靖曾經批准過許多人的死刑，對海瑞的處理卻一直沒有明確表態。如此又過了十一個月，這個當了四十五年皇帝的人終於死去。在徐階代為起草的遺詔中，他幾乎承認了自己所有的錯誤。
海瑞是在牢房裡得到訊息的。當時，他看見監獄負責人端來酒餚盛情款待，以為死刑在即，便坦然進食。但當對方告訴他萬歲爺已經駕崩，並祝賀他出獄有望時，海瑞卻放聲號哭，繼之以嘔吐，最後暈倒在地。sup/sup
出獄後的海瑞理所當然地成為英雄，同時也成為帝國的麻煩。內閣和吏部都認為，對於海瑞最好的安排是讓他擔任品級較高而實權較小的職務，因為他的精神固然可嘉，做法卻不可效法，也不宜提倡。然而海瑞卻不領情。升到正四品的南京通政使司右通政後，他給新皇帝上了一份奏摺，宣稱像他這樣連閒飯都吃不好的官員，其實應予革退。sup/sup
朝廷無奈，只好給他實權。
結果，中央和地方都雞飛狗跳。
見《明史·世宗本紀二》。
據《明史·職官志一》，戶部設十三司，其官郎中正五品，員外郎從五品，主事正六品。從正七品越過從六品而至正六品，是破格。
請參看《明史》之《胡宗憲傳》和《地理志五》。
見《明史·海瑞傳》。
見王國憲《海忠介公年譜》和《明世宗實錄》卷五百一十，兩書所記不盡相同。另據《明史·鄢懋卿傳》，鄢懋卿此時的職務應該是左副都御史。此事《海瑞集》和《明史·海瑞傳》也有記載，同時還請參看黃仁宇《萬曆十五年》。
據《海忠介公年譜》，嘉靖四十年海瑞原本應該升為嘉興府通判，但因鄢懋卿黨羽彈劾，次年改任興國知縣。
見《海忠介公年譜》。《明史·海瑞傳》稱上疏在嘉靖四十五年二月是不對的，因為這個月的初一他就下獄了。
見《海瑞集》和《明史·海瑞傳》。
見《明史·海瑞傳》和《海忠介公年譜》，又請參看黃仁宇《萬曆十五年》。
以上見《明史·海瑞傳》。
見《海瑞集》。