心高氣傲的高拱，第二天就坐了輛驢車出宣武門，途中竟然被錦衣衛的緹騎輪番追趕。這樣狼狽不堪地走到良鄉真空寺，張居正申請的驛站交通批文也到了。高拱仍然耿耿於懷，用河南家鄉話說：這個人真是又做師婆又做鬼！sup/sup
平心而論，這件事張居正做得還是真心實意，哪怕只是出於內疚。高拱也接受了安排，改乘驛車回家鄉。萬曆六年張居正回江陵葬父路過新鄭，兩人見面，又老又病的高拱竟放聲大哭。當年七月二日，高拱在家中去世，留下《病榻遺言》四卷，從自己的角度回顧了那段歷史。此書在後世廣為流傳，重塑了張居正的形象，也留下許多疑團。sup/sup
當然，這些都是後話。
高拱出京後，另一位同僚驚恐而死，張居正成了唯一的閣臣。六月十九日，皇帝在雲門臺單獨召見了他。當時他正因為覆視先帝陵墓中暑生病，在家休息。清晨接到聖旨立即匆忙趕來，陛下卻已經在寶座上等他。
張居正照例向皇帝行禮。
小皇帝說：先生為父皇寢陵，辛苦受熱。
張居正趕緊叩首謝恩。
小皇帝說：凡事要先生盡心輔佐。
張居正說：臣叨受先帝厚恩，親承顧命，敢不竭力盡忠以圖報稱。方今國家要務，唯在遵守祖制，不必紛更。至於講學親賢，愛民節用，又君道所先，乞聖明留意。
明神宗定陵陪葬品，1956年出土，現藏定陵博物館。
小皇帝說：先生說的是。
張居正說：天氣盛暑，望皇上保養聖躬。
小皇帝說：知道了。
又吩咐身邊太監：與先生酒飯吃（吃）！sup/sup
兩個人都沒有再說，許多話盡在不言中。小皇帝很清楚自己治不了國，必須依靠這位四十八歲的閣臣。張居正同樣明白，幼主獨相的機會千載難逢，應該趁機大展宏圖。什麼海瑞，什麼高拱，甚至徐階，都可以揮手告別。
張居正的時代開始了。
以上見《明史·馮保傳》。
此事真偽請參看樊樹志《萬曆皇帝傳》。
見《明史·高拱傳》和（明）王世貞《嘉靖以來首輔傳》卷七。
見《明史·神宗本紀一》。
見《明史·孝定李太后傳》。
以上見高拱《病榻遺言》卷三。
見樊樹志《萬曆皇帝傳》所引諸文獻。
見（明）文秉《定陵注略》卷一。
見《明史·馮保傳》。
以上見樊樹志《萬曆皇帝傳》所引諸文獻。
高拱卒日，見嶽天雷《高拱年譜長編》。高拱與張居正見面，見《嘉靖以來首輔傳》卷七。高拱大哭，是因為罷官之後馮保仍然要陷害他。此事比較複雜，這裡不展開。
以上見《明神宗實錄》卷二，參看《紀事本末》卷六十一。