儘管魏忠賢視新帝朱由檢只不過是一個符號，但他以退為進，一試時局的深淺。在熹宗過世僅僅八天之後，九月初一，魏忠賢向崇禎提出辭去東廠總督太監的職務。但崇禎不許。魏忠賢很快出手了第二招。九月初三，在魏忠賢的策劃下，客氏請求從宮中遷回私宅。這一次，崇禎猶豫了好長時間，才勉強同意。魏忠賢或許還不知道，這其實是崇禎的老成——對付魏忠賢欲速則不達，必須分而治之。
客氏出宮似乎成了推倒魏忠賢骨牌的第一推力，不過魏忠賢也絕對不會善罷甘休，他差不多把整個大明朝的官員都打造成魏忠賢骨牌了，要玩完大家一起玩完！九月初四，因為巴結魏、客而成為司禮監掌印太監的王體乾作垂垂老矣狀向熹宗提出辭職申請。按照《大明律》，司禮監掌印太監位在掌東廠太監之上，但王體乾為了巴結魏忠賢，平素竟甘願屈居其下。現如今，作為堂堂的司禮監掌印太監，王體乾主動跳出來為魏忠賢骨牌充當犧牲品，明擺著是向大明朝的皇家威權叫板……十八歲的崇禎以無比誠懇的態度挽留了王體乾。他推心置腹、聲淚俱下、曉之以情、動之以理，最後竟感動得老王發自肺腑地表忠心，就差說出是魏忠賢在背後指使他這麼做的了。這一回合，算是崇禎贏了。
但是歷史的小插曲說來就來。九月十四，右副都御史管南京通政司事楊所修義憤填膺地站出來，彈劾魏忠賢的親信兵部尚書崔呈秀、工部尚書李養德、太僕寺少卿陳殷、延綏巡撫朱童蒙等人，說他們不孝，父母過世了不在家丁憂，有違崇禎剛提出來的「以孝治天下」的施政綱領。他同時彈劾吏部尚書周應秋這麼多年來一直在混日子，提拔官員老是在搞平衡、和稀泥，「做人的底線到哪裡去了？為官者的良知到哪裡去了？」
魏黨成員被彈劾，魏忠賢馬上力保，他提醒崇禎，這些官員父母過世了不在家丁憂都是因為先帝奪情而留任的結果，對這樣盡忠體國、公而忘私的官員，不但不予以表彰反而一棍子打倒，這以後朝廷的工作還要不要人做了？而吏部尚書周應秋，那絕對是堅持原則的好官，楊所修不就是他老人家提上來的嗎？
魏忠賢的話讓崇禎很難反駁。倒魏陷入了僵局，但是一個王朝的聲浪已經開始了。十月二十二，工部主事陸澄源上疏彈劾魏忠賢。說他拉幫結派，黨羽遍佈神州，「盡廢君前臣名之禮」，是可忍孰不可忍。崇禎聽了，低頭不語，不置可否。
兩天後，兵部主事又上疏彈劾魏忠賢。兵部對崇禎遲遲不處罰魏忠賢覺得不可理解，崇禎聽了，還是低頭不語，不置可否。十月二十五，刑部員外郎史躬盛貼出了大字報，歷數魏忠賢的罪行：
舉天下之廉恥澌滅盡，
舉天下之元氣剝削盡，
舉天下之官方紊亂盡，
舉天下之生靈魚肉盡，
舉天下之物力消耗盡。
這些罪行看得滿朝文武大臣哭聲一片，但崇禎還是不置可否。官員們進一步施壓。倒魏運動此伏彼起。十月二十六，繼刑部員外郎史躬盛貼出了大字報後，一個小得不能再小的官員——海鹽縣貢生錢嘉徵上疏揭發魏忠賢之十大罪狀。崇禎看完奏疏後，召來魏忠賢，令內侍讀錢嘉徵疏。一條一條讀得慢條斯理卻又暗藏殺機，由此歷史進入拐點時刻——魏忠賢害怕了。他以重金賄賂太監徐應元，請他在崇禎面前為自己求情。魏忠賢本不必這麼做，如果他有和崇禎殊死較量一番的勇氣的話。事實上魏忠賢在這件事上是示之以弱，給了年輕的小皇帝一鼓作氣、扭轉乾坤的豪情或者說動力。崇禎帝斥責徐應元多管閒事，並且還為此專門下了一道諭旨，嚴辭呵斥魏忠賢：「朕思忠賢等不止窺攘名器、紊亂刑章，將我祖宗蓄積貯庫、傳國異珍異寶、金銀等朋比侵盜幾空；本當寸磔，念梓宮（先帝棺材）在殯，姑置鳳陽。（客、魏）二犯家產，籍沒入官。其冒濫宗戚俱煙瘴永戍。」崇禎還下令，把魏忠賢的生祠全都拆了，折價變賣資助遼餉。
崇禎在十一月初一下令將魏忠賢安置在鳳陽，此後魏忠賢被勒令火速離開北京前往鳳陽祖陵。十一月初六，當魏忠賢龐大的隊伍走到阜城縣南關的時候，崇禎的又一道諭旨如影隨形地跟到了：「……豈巨惡不思自改，輒敢將畜亡命，自帶凶刃，環擁隨護，勢若叛然。朕心甚惡……」此等情勢下，魏忠賢只好選擇自縊了。崇禎「詔磔其屍，懸首河間」，天啟七年（西元1627年）十二月二十三，崇禎開始打擊魏忠賢反革命團伙。崇禎帝下詔：「天下所建魏忠賢逆祠，悉行拆毀變價。」包括「五虎」「五彪」在內的魏忠賢集團骨幹分子受到懲處。這個歷時一年多的打擊行動由崇禎親任總指揮，並最後裁定。處罰結果毫無疑問是嚴厲的或者說毀滅性的：魏忠賢反革命團伙中魏忠賢、客氏二人磔死（凌遲處死）。崔呈秀等以「首逆同謀」罪立斬；劉志選等以「交結近侍」罪問斬，判秋後處決；魏廣微等十一人與魏志德等三十五人，全都充軍，罪名是「諂附擁戴」，太監李實等以「交結近侍又次等」罪，判充軍；顧秉謙等一百二十九人以「交結近侍減等」罪，判處有期徒刑三年；黃立極等四十四人被開除公職，永不敘用。這樣在「魏忠賢欽定逆案」中，前後共有二百六十餘人受到處置，而魏忠賢這個亂世年代發跡與覆滅的故事至此塵埃落定。