等潘祖蔭回部，說與屬下，承辦司員手段老到，將行文內務府，要姓魏的蘇拉到案一事，擱在一邊。先傳訊當日神武門值班護軍，多方研求，確證不誤，才通知內務府，詳細載明魏蘇拉的年歲相貌，指出他是案中極有關係的要犯，「請即日押送刑部，歸案嚴訊。」
刑部辦此案的經過，李蓮英不斷在打聽，同時也知道恭王主張嚴辦，看來這一案要想照原來的辦法搪塞，不易辦到，如果魏豐被逮到案，審明實情，則有意作偽袒護的用意何在？頗難分辯。所以他又在敬事房的檔籍上改動了一下，註明魏豐是出事當日，請假出宮。這樣就比較接近事實，即有破綻，也易於彌補。
於是等內務府轉來公事，敬事房便照此申覆，辦好公文拿給李蓮英看時，他卻又有顧慮。
「咱們做事不能顧前不顧後。」他問，「這封公事，到了刑部，想想看，人家會怎麼辦？」
「自然是抓魏豐到案。」劉玉祥說，「如果是刑部行文到直隸總督衙門，一層層轉下去，還得有些日子，就怕軍機上直接通知步軍統領衙門派人到京東，那可一抓就著。」
「就是這話nfea3，我看魏豐是逃不掉了！與其將來等他有了口供，再來要人，倒不如咱們先送幾個去。」
「這話說得是。」劉玉祥說，「軍機奉旨，派的寶中堂會審，這個老頭兒好說話，大事化小，總有幾分把握。」
「我正就是這個主意。就這麼辦吧！」
於是根據崔玉貴在劉振生那裡哄出來的真話，將教唆過魏豐的太監中，找了幾個平日辦事不力的，直接移送刑部。公文當然也改過了，自己為自己渲染了一番，說是如何細心查究，追出根由，但對誑騙劉振生進宮的原因，卻一再申言，是那些太監愚昧糊塗的戲謔，「並無他意。」
送出公事，李蓮英親自去看參與會審的內務府大臣恩承，話中表示投鼠忌器，此案如果辦得過嚴，牽連太廣，深怕人心震駭。同時太監們惶惶不安，或許亦會激出其他事故，希望恩承向寶nfda1進言，速速了結。
太監在統屬上歸內務府管，所以恩承就為本身的利害，也得聽從李蓮英的話，向寶nfda1一提，頗以為然。在刑部，正好依律從輕，有助於了結午門一案，因而亦欣然同意，等將魏豐逮捕到案，問了兩堂，便即奏復結案。
這一案共分為三起來結，第一起是當日神武門值班的護軍統領載鶴，交部嚴議，該班章京及兵丁革斥。第二起是魏豐及教唆他騙劉振生進宮，還有劉振生所經各處值班失察的太監，依照罪名輕重，分別摘頂、罰銀、斥革、責打、發遣等處分。這兩起奉懿旨裁決後，當日執行，發遣的由護軍立即押解出宮。
第三起專為處置劉振生一個人，以「素患瘋疾，混入宮禁，語言狂悖，實屬罪無可逭」的罪名，被判處了「絞立決」。在刑部大獄內，一條繩子，三收三放，冤冤枉枉送了一條命。
於是刑部接著處理午門一案，依舊照原來的擬議復奏。這已經是瘋子混入長春宮的二十天以後，慈禧太后在這二十天中，病症又減了好些，所以親自御殿裁決。
「我真不明白，」她悻悻然地說，「刑部為什麼這麼固執？」
「刑部依律辦理。請聖母皇太后明鑑。」恭王替刑部說好話，「刑部司員盡心推求，既不敢枉法，更不敢忤旨，處境很難。」
「這是護軍抗旨，不能拿一般的情形作比。」慈禧太后說道，「以前總有抗旨的例，讓他們查出來看。」
恭王答應著，立即通知刑部查例，這一案先擱一擱，商議其他政務。很快地，刑部有了答覆：「抗旨無例，照違制例」，抗就是違。
違制除非情節重大，譬如領軍出征，不遵指授的方略，以致貽誤戎機，損兵折將，自然難逃一死，或者像崇厚那樣，擅作主張，喪地辱國，亦有取死之道。如像這一案的午門護軍那樣，是決沒有死罪的。
由於恭王及軍機大臣力爭，刑部的復奏，懸而未決。退朝之後，慈禧太后大為不樂，一口氣憋不住，派李蓮英傳諭，召見刑部及內務府的堂官。
「你們擬得太輕了。」慈禧太后面色凜然，「一定要加重！趕快重擬復奏。」