宗教裁判所是中世紀和近代初期天主教的司法機關，用以鎮壓異端和巫術和法道。
這個機構是教皇格列高利九世於1231年設立。異端嫌疑犯被逮捕後，將會受宗教法庭審判；1252年教皇英諾森四世批准用刑以使犯人懺悔告解。
被認定為異端分子的人如拒絕改變信仰，就要轉交世俗司法當局判處死刑。
不過更讓宗教裁判所臭名昭著的就是宗教公判大會了。這是一種公開處死異端的儀式。在歷史上大法官托爾克馬達曾以火刑燒死近2000名異端分子。
有無數的無辜者和科學家先驅被扣上了異端的帽子從而被送上了火刑柱。這也是教廷千年以來最為人所詬病的地方。
科學家阿斯科裡，僅僅因為論及地球是球形的，在1327年就被宗教裁判所用火燒死。此外為人所知的還有布魯諾，文藝復興時期的思想家、科學家，他15歲時進入修道院做見習修土。因對某些天主教教義產生懷疑，被指控為異端，被開除教籍。
後來他奔走於歐洲各國，宣揚哥白尼的「日心論」學說。1592年，布魯諾被騙回意祖國，1600年2月17日，布魯諾被宗教裁判所活活燒死在羅馬的鮮花廣場上。臨刑時高呼：火不能征服我，未來的世紀將會知道我的價值。
後來人類進入文明社會，國家和政府的力量逐步超越了宗教裁判所這個宗教機構，宗教裁判所才從歷史上消失了。然而這個機構並沒有真正的洇滅在歷史之中，而是在教廷的某個角落被隱藏了起來。
現在的宗教裁判所，是教廷的最高武力機構。在這個組織中，聖騎士都只是最低階別的戰鬥成員。
雖然教廷對外宣稱他們只有12名聖騎士，但是教廷的高層都知道，在宗教裁判所這個機構，有幾十名聖騎士，甚至還有很多比聖騎士還要恐怖的怪物。
聽到紅衣大主教阿洛伊西奧建議讓宗教裁判所介入，所有人都驚呆了。就連教皇也遲疑了。這個機構實在是名聲太響亮了，教廷用了幾百年時間才讓人們淡忘了這個機構，現在萬一讓它們在出現在人們的面前，恐怕會對教會的形象造成極大的影響。
斯托格爾大驚失色，於是質問道：「阿洛伊西奧大主教，你可知道你的建議意味著什麼。宗教裁判所如果出手，萬一有所閃失，這件事情暴露出去，會對我們梵蒂岡的形象造成多麼大的損害。
另一方面，如果歐洲的那些黑暗勢力，這些教廷的宿敵們知道宗教裁判所重新出現了，他們會有什麼樣的激烈反應，你考慮過這事情的後果嗎？」
阿洛伊西奧冷笑一聲：「我當然考慮過。不過宗教裁判所既然存在，那必然是有它的必要性。今天我們教廷面臨的危機，正是宗教裁判所存在的意義。否則的話幾百年前我們就將它取締了，還留它到現在做什麼。
至於咱們的那些老對頭，他們如果敢惹事更好，這些年我們對他們太仁慈了，他們有些膨脹了，正好讓宗教裁判所對他們進行審判和淨化。」
教皇思索了半天，開口問道：「那麼，宗教裁判所準備好了嗎？他們已經幾百年沒有參與任何行動了」
沒有人能夠回答。就在這個時候，一串沉重的腳步聲響起。有人走進了大殿。
眾人紛紛轉過頭去觀看。只見從殿下走來一人，此人身穿米色長袍，一頭銀色的長髮，鬍鬚也是顏色的，臉上寫滿滄桑。