風暴給第31特混艦隊帶來的影響要比哈爾西所想像得嚴重得多，甚至比唐帝國特混艦隊都要嚴重得多。至少，唐帝國艦隊裡的三艘航母都是大型艦隊航母，抗風浪的能力還不算太糟糕，而哈爾西手裡，那三艘小型航母在風浪面前就顯得太脆弱了。
航母受到風暴影響最嚴重的地區並不是太平洋，而是北大西洋。北大西洋是世界上風暴最猛烈的海域之一，而航母都是高幹舷戰艦，受風面積很大，且飛行甲板實際上是敷設在主甲板之上的一層附加甲板，因此很容易在風暴中受到破壞。在北大西洋上，英國海軍就有好幾艘航母被風暴所破壞，這也是英國海軍為什麼不太重視航母的一個重要因素。
最先採用封閉式艦艏設計的就是英國海軍的航母，採用開放式艦艏設計的航母在風暴中極為脆弱。為了抵抗風暴，英國海軍甚至設計出了全封閉式機庫的航母。結果，英國海軍幾艘排水量在兩萬噸以上的航母的載機數量都在60架左右，而同期唐帝國，美國，乃至日本的類似大小的航母的載機數量都要多得多，顯然航母要加強結構強度，提高抵抗風暴的能力其主要的代價與犧牲就是削弱了航母的航空作戰能力。
實際上，航母的戰鬥力就來自於其航空作戰能力，沒有了航空作戰能力的航母與運輸船沒有多大的分別。另外，使用航母的核心戰術思想是進攻，而不是防禦，進攻是航母戰勝對手的唯一辦法。在這些方面，唐帝國海軍與美國海軍都極為強調航母的進攻能力，也就格外強調了航母的航空作戰能力，為了儘可能提高航母的航空作戰能力，在條約時期，雙方的航母都以載機多而出名。相反。如同英國這種將航母當作了戰列艦的護航戰艦使用，且大部分任務是防禦，而不是進攻的海軍來說，其強調地是航母的適應能力，而不是強大的航空打擊力量。
這些分別都決定了唐帝國與美國海軍的初期航母的試航能力並不理想的特點。實際上，即使到了「湖」級與「埃塞克斯」級，兩國的航母在適航能力方面仍然比較糟糕。這兩種航母的排水量增加了不少，可仍然存在著重心太高的問題（後來。」埃塞克斯」級降低了防空火炮的備彈數量，而「湖」級則取消了上層甲板上很多不必要的隔離裝甲帶，都是為了降低航母的重心，增強航母的穩定性）。大型艦隊航母尚且如此，小型航母的情況就可想而知了。
「獨立」級是改造而來的小型航母，其機庫內只能容納30架戰機，而為了提高航空作戰能力，美國海軍還在航母的飛行甲板上增加了15個繫留點，可以繫留15架作戰飛機，使航母的載機數量達到45架。這幾乎是「埃塞克斯」級航母標準載機數量的一半了。可實際上。在風暴中，別說儲存繫留地15架作戰飛機，就連保管好航母機庫裡地30架作戰飛機都非常的困難。
哈爾西在看到了這三艘航母的效能資料的時候。就知道這三艘航母只能在風平浪靜的海面上作戰，而無法到風暴區內活動（航母的極限橫傾與縱傾角度就是航母試航能力的一個重要指標）。因此，哈爾西發現風暴不會立即離開，而他必須得讓艦隊脫離風暴區，到南面的海域作戰的時候，他首先就命令三艘「獨立」級航母組成的編隊全速南下，爭取首先離開風暴區，免得被風暴給摧毀。可實際上，這三艘航母也差不多快要被風暴給摧毀了。
在脫離風暴區之前，為了增加航母的穩定性。以及避免繫留的戰機撞壞了航母飛行甲板上的裝置，三艘「獨立」級航母都不約而同地將繫留在飛行甲板上的戰機給拋棄掉了。但是這並沒有能夠避免災難的發生。因為排水量過小，而且採用的是開放式艦艏，在改造時為了控制排水量（實際上是為了保證速度），航母的主甲板與飛行甲板之間的承力結構並不是很牢固。結果，在脫離風暴之前，「普林斯頓」號航母的飛行甲板前端幾乎被風暴給徹底摧毀，後方的機庫也受到了影響，機庫前端的幾架戰機被損壞。」獨立」號地飛行甲板被吹掉了至少五塊。雖然航母上有備用木板（沒有采用裝甲飛行甲板，而是用木板敷設的飛行甲板），但是要修復飛行甲板至少需要好幾個小時的時間，同時還得讓航母首先穩定下來。」貝勞伍德」號的情況要稍微好一點，只有裸露在外的一些航空裝置受到了影響。結果，這三艘航母都在風暴中受了傷。
哈爾西在知道了這一情況之後暴跳如雷，差點立即解除三位艦長的職務。到三點半的時候，哈爾西得到了明確的答覆。天亮前，「貝勞伍德」號可以安排戰機起飛，「獨立」號至少要等到七點半之後才能修好飛行甲板，而「普林斯頓」號必須要返回港口修理，無法在海上維修。
此時憤怒是解決不了任何問題的，哈爾西也控制住了自己的怒火。
他只能讓「普林斯頓」號航母編隊先行返回維拉港，退出了這次的作戰行動。同時讓「獨立」號加緊時間搶修，把原本應該由「獨立」號派出的偵察機安排給了「貝勞伍德」號。可問題是，此時「貝勞伍德」號只有30架載機，其中有12架戰鬥機，18架sbd，而能夠執行偵察任務的是sbd，而不是749。換句話說，在天亮前，只有「貝勞伍德」號可以派出18架偵察機，而這要比之前確定的24架偵察機少了6架。
缺少六架偵察機還是小事，小型航母編隊為了儘快脫離風暴的影響範圍，是朝東南方向航行的，而不是與艦隊航母編隊一樣，朝著西南方向航行的。換句話說，在脫離了風暴影響範圍之後，小型航母編隊還需要向西北航行，前來與艦隊航母編隊會合，而「貝勞伍德」號派出偵察機的時間不是五點半。而是六點，比兩艘艦隊航母派出轟炸機的時間至少晚半個小時。
在艦隊趕來的時候，「勇猛」號與「大黃蜂」號航母都是滿額攜帶戰機的，每艘航母上有36架f4u，48架sbd，24架tbd，以及12架作為偵察機使用的sbd。而在風暴中，「勇猛」號航母上損失了8架戰機（4架sbd。3架tbd，1架749），「大黃蜂」號損失了11架戰機（5架sbd，4架tbd，2架f4u）。
難題再次交到了哈爾西地手裡。為了確保找到唐帝國的航母特混艦隊，哈爾西至少需要派出36架偵察機，而為航母護航的巡洋艦上的水上飛機都被摧毀了，也就是說，這36架偵察機都得由航母出動。就算減少到最低限度，只安排24架偵察機。在「貝勞伍德」號無法派出偵察機的情況下。兩艘艦隊航母得各安排12架偵察機。美國航母攜帶的偵察機都是sbd的偵察型號，實際上就是安裝了效能更好的電臺地sbd轟炸機。