在「富蘭克林」號航母返回了珍珠港之後，斯普魯恩斯就親自負責這艘航母的修復工作。而這次修復航母所需要的時間就要比上一次多得多了。
相對來講，航空炸彈裝藥量的比重要比航空魚雷大得多，可航空魚雷對戰艦的破壞卻要比炸彈大得多，因為魚雷是直接命中戰艦水線以下部位的，而炸彈一般都命中戰艦水面上的部位。比如在「中途島海戰」
中，「富蘭克林」號捱了四枚炸彈，可這四枚炸彈只破壞了戰艦的水上部位，對戰艦的艙室損壞很大，但是沒有在戰艦的水線下造成很大的破壞，因此在維修的時候，航母不需要被拖入船塢，只需要停靠在有重型起重機的碼頭旁就能進行維修作業了。而這次，「富蘭克林」號是被一條魚雷擊中的，其艦艏水線下部位有一個巨大的窟窿，導致相鄰的大量艙室進水，而修復工作的第一步就是要把這個窟窿補上，然後抽出艦體裡的積水。因此，航母就必須得拖到船臺上進行維修。
維修工作從八月二十九日開始，航母在當天就被拖上了船臺，並且首先修復艦體水線下的損傷，然後光是抽出艦體內的積水就花了一天的時間。接著，數百名海軍船廠的工人與工程師開始檢查航母的主體結構，在確認主體承力結構沒有遭到破壞之後，就拆掉了受損部位上方的飛行甲板與主甲板，修復航母內部的損傷，更換一些新的裝置。完成這一步地修復工作之後。
再裝上主甲板與飛行甲板，做最後的檢查後，確定是否存在安全隱患。做最後的修補工作。
實際上，「富蘭克林」號航母地損傷情況並不止這麼簡單。在上次的修復工作中。因為時間倉促，留下了很多地隱患（這些隱患有的甚至無法消除，這也是「長江」號航母為什麼一直沒有能夠完全恢復戰鬥力的原因），修復工作所需要的時間遠遠超過了預先的計劃。直到九月十日，工程師才徹底檢查完了這艘航母。確定了修復計劃。當斯普魯恩斯得知修復航母至少需要一個月的時間後，他只給了工程師十天的時間，也就是說，在九月中旬的最後一天，「富蘭克林」號的修復工作必須完成！
在修復「富蘭克林」號航母期間，斯普魯恩斯也一直關注著戰場上的變化。第三艦隊慘遭殲滅，這讓他難以相信，可他不得不接受這個事實，甚至不得不接受哈爾西陣亡的事實。可問題是，現在只剩下第五艦隊。一艘艦隊航母，三艘小型航母這點兵力，而唐帝國海軍至少還有七艘艦隊航母。兩艘小型航母。另外，在巡洋艦，驅逐艦等方面，唐帝國海軍的優勢也極為明顯。這仗怎麼打？
在得知唐帝國海軍新成立的第五特混艦隊奔赴南大西洋戰區之後，斯普魯恩斯稍微鬆了口氣。雖然第五特混艦隊就只有一艘艦隊航母，兩艘小型航母，但是這支艦隊如果留下來的話，美國海軍幾乎沒有任何還手之力，而在第五特混艦隊離開太平洋戰場後，唐帝國海軍就得安排另外一支特混艦隊到中太平洋戰場上來，結果就是，唐帝國海軍兩支能夠作戰的特混艦隊分別部署在兩個方向上，而第五艦隊有能力對任何一支特混艦隊發動一次致命地打擊，美國海軍至少還有一點點希望吧。
接著，第一特混艦隊返回那霸的訊息也發了回來，斯普魯恩斯在得到訊息後立即就去找了尼米茲，把自己的判斷告訴了尼米茲。即唐帝國海軍正在讓艦隊輪換休整，短期內，第一特混艦隊不會前往西南太平洋戰區，在那邊只有第四特混艦隊在珊瑚海上活動，如果能夠抓住這個機會，幹掉第四特混艦隊的話，那麼美軍的被動局面就將有所改觀，甚至有希望奪回主動權。而唯一的辦法就是讓第五艦隊南下，去珊瑚海上尋找第四特混艦隊決戰。
這是斯普魯恩斯第一次提出率領第五艦隊南下的建議，可尼米茲並沒有急著答應。當時，沒有任何證據證明唐帝國海軍會讓艦隊輪換休整，斯普魯恩斯只是在猜測而已。另外，現在戰局還沒有完全明朗，唐帝國海軍也需要時間調整戰線與兵力部署，根本就不需要急著安排第五艦隊南下。
沒過幾天，第一份關於唐帝國海軍調整中太平洋戰場兵力部署地情報送到了太平洋戰區司令部。斯普魯恩斯在第一時間內就獲得了訊息。
這下，他也有點疑惑了，可他並不相信唐帝國海軍會在好不容易取得戰略優勢的時候將兵力分散到兩條戰線上，發動秒年個次都難以快速獲得勝利的進攻，這簡直就是在浪費軍人用生命與鮮血換來的寶貴勝利！
接著，越來越多的情報送來，斯普魯恩斯仍然不太相信唐帝國海軍會在西南太平洋上的戰鬥還沒有獲得決定性的勝利之前就分兵中太平洋，這與唐帝國海軍在太平洋戰場上堅持了一年多的戰略方向是完全背道而馳的。
在此期間，斯普魯恩斯多次向尼米茲提出了他的想法，以及建議，即第五艦隊南下珊瑚海，先對付第四特混艦隊，然後回師中太平洋。斯普魯恩斯也有充足的理由，即唐帝國海軍就算將進攻夏威夷群島，那麼其戰役準備時間都需要一個月以上，而發起進攻的時間肯定在十月份，甚至是十一月份。只要第五艦隊行動迅速，那麼完全有可能趁第一特混艦隊不在珊瑚海的機會幹掉第四特混艦隊，再返回中太平洋戰場，拖住第一特混艦隊，讓麥克阿瑟能夠守住新赫布里底群島，而在中太平洋上，只要第五艦隊及時回援，那麼就有能力守住夏威夷群島。
斯普魯恩斯的主張有著明確的目的，尼米茲甚至要決定採納他的意見了，可就在這個時候。英法聯軍在歐洲西線戰場大敗的訊息傳來，接著，美國總統親自跟尼米茲通了電話。尼米茲也保證會全力守住夏威夷群島。結果，斯普魯恩斯率領第五艦隊南下地計劃就只能取消了。