當時王允與呂布和僕射士孫瑞謀劃殺董卓。有人在布上寫了個「呂」字，揹著在集市上走，唱著：「布啊！」有人告訴董卓，董卓沒有悟出來。初平三年四月，皇帝的病罷好，在未央殿舉行盛大集會。董卓身穿朝服登車，接著馬受驚掉在泥裹，回屋內換衣服。其妾不讓他去，董卓不聽，就出發了。於是夾道排列軍隊，從他的駐地營壘到皇宮，左右步兵騎兵，一層層嚴密護衛，令呂布等在前後警戒。王允和士孫瑞秘密上奏殺董卓之事，讓士孫瑞自己寫下韶書送給呂布，令騎都尉李肅和與呂布同心的勇士十餘人，穿上董卓衛士的服裝在北掖門內等著董卓。董卓快走到時，馬受驚不肯往前走，他覺得奇怪害怕想回去。呂布勸他進宮，於是就進了宮門。李肅用戟刺他，董卓裹面穿著銷甲刺不進，手臂受傷掉下車來，回頭大叫：「呂布在哪裹？」呂布應聲說：「有詔書討伐賊臣。」董卓大罵：「餵養的狗竟敢這樣！」呂布應聲持矛刺董卓，促令士兵殺了他。主簿田儀和董卓的奴僕跑到他屍體前，呂布又殺了他們。使人騎馬帶著赦免的韶書，號令宮廷內外。士卒都高呼萬歲，百姓們在街道上載歌載舞。長安城中男女賣掉珠寶衣服買酒肉慶賀的，擠滿了街上的店鋪。朝廷命皇甫嵩到鄘塢攻打董卓的弟弟董曼，殺了他母親妻子男女老少，把他的家族全部殺光。於是把董卓的屍體扔在街上示眾。天氣當時漸熱，董卓一向肥胖，屍體的油脂流到地上。守屍的官吏用芯子點上火放在董卓肚臍眼裹，一直燃燒到天亮，這樣延續了好幾天。袁氏的門生們又把破碎的董卓屍體聚攏起來，燒成灰撒在道路上。他的城堡中藏有金子二三萬斤，銀子八九萬斤，錦帛穀米珍奇玩物堆積如山。
當初，董卓以牛輔為女婿，平素十分親信，派他帶兵駐紮陝。牛輔分派他的校尉李催、郭汜、張濟帶步騎兵數萬，在中牟打敗河南尹朱儁。趁機搶掠陳留、穎jl[各縣，殺擄男女，所過之處搶掠一光。呂布就派李肅帶著朝廷韶命到陝地討伐牛輔等人，牛輔等與李肅交戰，李肅敗逃到弘農，呂布殺了他。後來牛輔營中無故大驚，牛輔害怕，就帶著金銀珠寶翻城牆逃走。他的隨從貪圖他的財物，斬了牛輔，把他的頭送到長安。
李催、郭汜等人因為王允、呂布殺了董卓，因此恨幷州人，把在他們軍隊中的數百名幷州男女統統殺死。牛輔死後，眾人無所適從，打算各自散去。李催等人害怕，就先派人到長安，乞求赦免。王允認為一年內不能兩次赦免，不答應他。李催等人更加害怕，不知該怎麼辦。武威人買謝當時在李催軍中，鼓動他們說：「聽說長安城裹議論要殺光涼州人，各位如果丟下軍隊獨自行路，那麼一個亭長就能把你們綁起來。不如一起領兵向西，以攻打長安，為董公報仇。事情成功，奉國家以匡正天下；如果不成，再逃走也不晚啊。」李催等人認為說得對，互相議論說：「京城不赦免我們，我們要以死相拼。如果打下長安，就得天下了；打不下，就搶了三輔的婦女財物，西歸故鄉，還可以多活幾天。」眾人認為對，於是共同結盟，率領敷千軍隊，晝夜西行。王允聽說後，就派董卓過去的將領胡軫、徐榮在新豐迎擊。徐榮戰死，胡軫帶著兵投降。李催沿途收羅散兵，等到長安，已經十餘萬人，與董卓的舊部下樊稠、李蒙等人會合，包圍長安。城牆高陡不能攻打，守了八天，呂布軍中有蜀兵在城內叛變，接應李催軍得以入城。城被攻破，縱兵擄掠，死的有一萬餘人。殺了衛尉種拂等人。呂布戰敗逃出城外。王允保護天子守在宣平城門樓上。這時大赦天下。李催、郭汜、樊稠等都封為將軍。於是包圍了門樓，共同上表要司徒王允出來，問他「太師有什麼罪」。王允無奈只好下來，幾天後被殺。李催等人把董卓葬在郡，並收取董氏焚屍骨灰，放在一口棺材裹下葬。下葬那天，風大雨大，雷擊董卓墓，雨水流進墓穴，把棺材漂了起來．
奎值又升任車騎將軍，開府，領司隸校尉，假節。室巡為後將軍，：叄姻為右將軍，退渣為鎮東將軍，都封列侯。奎值、塾擔、墜周共同執掌朝政。張搪出京駐守至遞。任命買翅為左馮翊尹，還要給他封侯。賈翅說：「我造主意不過是救命之計，哪有什麼功勞！」堅決推辭才作罷。改任為尚書典選。
第二年夏天，大雨晝夜不停下了二十多天，百姓被沖走淹死，風冷得如同冬天。皇帝派御史裴茂審理欽犯案子，原來關押的有二百多人，其中有被李催冤枉的，李催怕裴茂把他們放出來，就上表奏告裴茂擅自釋放囚徒，懷疑他別有用心，要求把他抓起來。朝廷下詔說：「災害和反常的事物不斷出現，婬雨成災，使者奉命佈施皇恩，赦免那些罪過輕微的，以求符合天意。想化解冤仇還能再加罪於他嗎！什麼也不再追問。」
當初，董卓入關時，邀韓遂、馬騰一起共謀山東。韓遂、馬騰見天下將亂，也想依靠董卓起兵。興平元年，馬騰從隴右來朝見皇帝，駐紮霸橋。當時馬騰私下有求於李催，沒達到而發怒，於是就和侍中馬宇、右中郎將劉範、前涼州刺史獨劭、中郎將杜稟合兵來打李催，連戰幾天不分勝負。韓遂聽到了，就率部眾來想使馬騰、李催和解，不久又和馬騰聯合起來。李催派他哥哥的兒子李利和郭汜、樊稠與馬騰等人戰於長平觀下。韓遂、馬騰戰敗，斬首萬餘級，種劭、劉範等都戰死。韓遂、馬騰逃回涼州，樊稠等人又追擊。韓遂派人對樊稠說：「天下事反覆無常難以預料，你我同鄉，今天雖有些小摩擦，恐怕還會走到一起的，想和你談一談。」於是二人並馬拉著手臂，說笑了很久。軍隊撤回後，李利告訴李催說：「樊稠、韓遂並馬說笑，不知說的什麼，但看看關係很親密。」於是李催、樊稠開始互相猜疑。但還是讓朝廷加任樊稠與郭汜開府，與三公合為六府，都參與選拔舉薦官吏。
當時長安城中盜賊管制不住，白et搶劫，李催、郭汜、樊稠於是把城中分成三份，各守其地，還是不能控制，而他們的子弟橫行不法，侵害百姓。當時穀米一斛五十萬錢，豆麥二十萬，人吃人，白骨堆積，汙穢滿路。皇帝派侍御史侯汶搬出太倉米豆為饑民做粥，過了幾天死的人數並未下降。皇帝懷疑賑濟有假，便親自做粥檢驗，得知虛假後，派侍中劉艾出朝責備有關人員。於是尚書令以下都到宮門前謝罪，奏請逮捕侯汶審問。下詔說：「不忍把侯汶送去審判，可以杖五十。」從此以後百姓多得到救濟而保全性命。
第二年春天，李催乘聚會之機把樊稠殺死在座位上，從此諸將互相猜疑，李催、郭汜又整頓兵馬互相攻殺。安西將軍楊定，是董卓舊時部將，害怕李催加害，就和郭汜合謀把天子接到他們的營內。李催得知了他們的計謀，立刻派他哥哥的兒子李暹帶數千人包圍皇宮，用三輛車子接天子、皇后。太尉楊彪對李暹說：「自古以來的帝王，沒有住在臣子家裹的。各位做事，要上順天意，怎麼能這樣！」李暹說：「將軍主意已定了。」皇帝於是就到了李催的營中，楊彪等人都徒步跟隨。亂兵進入宮內，搶劫宮女財物，李催又把宮廷裡的金帛車輦器物服飾搬走，而放火把宮殿官署燒光。皇帝派楊彪與司空張喜等十餘人勸李催、郭汜和解，郭汜不答應，遂即把公卿扣作人質。楊彪對郭汜說：「將軍懂得人世間的道理，怎麼能君臣相爭，一人劫持天子，一人扣押公卿，這樣做可以嗎？」郭汜發怒，要拿刀殺了楊彪。楊彪說：「你尚且不服從朝廷，我難道還求生嗎！」左右之人多來勸解，郭汜才作罷。於是領兵攻打李催，箭射到了皇帝跟前，還射穿丁李催的耳朵。李催的將軍楊奉本是白波賊頭領，帶兵來救李催，於是郭汜的軍隊才退回。
當天，李催又把皇帝搬到他的北城堡，衹有皇后、宋貴人和皇帝在一起。李催派校尉把門，斷絕內外聯絡。不久又想把皇帝遷到池陽黃白城，君臣都害怕起來。司徒趟溫解說了半天，才作罷。朝廷派謁者僕射皇甫酈勸和李催、郭汜。皇甫酈先去勸說郭汜，郭汜就答應了。又到李催那裡，李催不聽。說：「郭多是個盜馬賊罷了，怎麼敢和我一樣呢！一定要殺了他。你看我的用兵韜略和軍隊，夠不夠收拾郭多？郭多又劫持公卿，做出這樣的事，而你還想幫助他嗎！」郭汜又名郭多。皇甫酈說：「如今郭汜扣押公卿，而將軍脅迫君主，誰輕誰重呢？」李催發怒，呵斥趕走皇甫酈，又命令虎賁王昌追殺他。王昌假裝沒追上，皇甫酈得以倖免。李催就自封為大司馬。和郭汜一連幾個月互相攻殺，死者以萬計數。
張濟從陝來調解二人，想把皇帝暫時遷到弘農。皇帝也思念舊京，於是派人懇請李催要求東歸，去了十趟才獲准。車駕即日出發。李催離長安駐紮曹陽。封張濟為驃騎將軍，又回陝駐守。升郭汜為車騎將軍，楊定為後將軍，楊奉為興義將軍。又封牛輔以前的部下董承為安集將軍。郭汜等人一起護送天子車駕。郭汜又想脅迫皇帝到酈去，楊定、楊奉、董承不答應。郭汜怕出事，就丟下軍隊回去找李催。車駕走到華陰，寧輯將軍段煨準備了服飾車馬和公卿以下官員的生活物資，請皇帝到他營中去。當初，楊定和段煨有矛盾，於是就誣蠛段煨要造**，於是攻打他的營寨，十幾天打不下來。而段煨仍舊供給皇帝膳食，供養百官，始終沒有二心。
李催、郭汜已後悔放天子束歸，於是來救段煨，趁機想劫持皇帝西行。楊定被郭汜攔截，逃奔荊州。而張濟和楊奉、董承不和，就反而聯合李催、郭汜，一起追趕皇帝車駕，大戰於弘農束澗。董承、楊奉兵敗，死了的百官士卒數不清。都丟下女眷輜重，皇帝用的器物符契簡策法典圖籍，丟得精光。射聲校尉沮俊受傷落馬，李催問左右的人說：「他還能活嗎？」沮俊罵他說：「你們這些兇徒逆賊，逼迫天子，亂臣賊子沒有像你們這樣的！」李催叫人殺了他。天子於是露宿在曹陽。董承、楊奉假意和李催等人聯合，而秘密派人到河東，聯合以前白波的頭領李樂、韓暹、胡才以及南匈奴右賢王去卑，一同率領他們的部眾數千騎而來，和董承、楊奉共同攻擊李催等人，大敗他們，斬首數千級，皇帝的車駕才得以前進。董承、李樂護衛左右，胡才、楊奉、韓暹、去卑做後衛。李催等又來攻戰，楊奉等大敗，死的人比在束澗時還多。從束澗開始四十里當中攻殺連續不斷，好不容易到陝，於是紮營守衛。當時遭難之後，虎賁羽林衛士不滿百人，都有離去的心思。董承、楊奉夜裹偷偷商量過黃河，讓李樂先去準備船隻，舉火為應。皇帝步行出營，到了黃河邊要過河，岸高十幾丈，就用絹繫著縋下去。其餘人有的從岸邊往下爬，有的從上面跳下來，死亡傷殘，不知有多少。爭著往船上爬的，難以禁止，董承用兵器亂砍，船倉裹剁下的手指頭一捧一捧的。同天子一起過河的衹有皇后、宋貴人、楊彪、董承以及皇后的父親執金吾伏完等數十人。宮女都被李催的兵搶走，凍死淹死的很多。到了大陽以後，住在百姓家裹，然後天子到李樂營裹去。百官飢餓，河內太守張楊派數千人背米進貢糧餉。皇帝這才坐著牛車，定都在安邑。河東太守王邑奉獻布帛，都給予公卿以下百官。封王邑為列侯，拜胡才為徵東將軍，張楊為安國將軍，全都假節、開府。其他帶兵的小人，爭相來求封官，以至刻印來不及，就用錐子刻畫。有人帶酒肉來天子逭裹吃喝。皇帝又派太僕韓融到弘農，與李催、郭汜等人講和。李催這才放回公卿百宮，也歸還一些宮女家眷，以及皇帝的車駕器物服飾。
當初，皇帝入關時，三輔的戶口還有數十萬，自從李催、郭汜互相攻殺，天子束歸以後，長安四十多天成為空城，身體強壯的四處逃散，衰弱的被人吃掉，二三年之內，關中再無人煙。建安元年春天，諸將爭奪權利，韓暹攻打董承，董承投奔張楊，張楊讓董承先修繕洛陽的宮殿。七月，皇帝回到洛陽，入楊安殿。張楊把這看成是自己的功勞，所以就用「楊」字來給宮殿命名。他對諸將說：「天子應當是天下人的天子，人人都有保護的責任，朝廷裹自有公卿大臣，我應該出外抵禦外患，在京城裹幹什麼？」就回了野王。楊奉也出京駐紮在梁。於是朝廷封張楊為大司馬，楊奉為車騎將軍，韓暹為大將軍，兼任司隸校尉，全都授予符節斧鈸。韓暹和董承都留在京中守衛皇宮。
韓暹居功自傲為所欲為，擾亂政事，董承感到憂慮，秘密召引兗州牧曹操。曹操於是到朝廷貢奉物品，贈給公卿以下百官，趁機奏報韓暹、張楊的罪過。韓暹怕被殺，單騎投奔楊奉。皇帝因為韓暹、張楊有保駕之功，下詔說一切不再追問。於是封衛將軍董承、輔國將軍伏完等十餘人為列侯，追贈沮局為弘晨太守。酉操以洛陽殘破為由，即把皇帝遷到許。楊奉、韓暹想要阻攔車駕，沒有趕上，曹操攻擊他們，楊奉、韓暹投奔袁術，即在揚州、徐州一帶肆意作惡。第二年，左將軍劉備誘殺了楊奉。韓暹害怕，逃回幷州，路上被人殺死。胡才、李樂留在河東，胡才被仇家殺害，李樂病死。張濟軍無糧，離開自己的地盤到南陽，攻穣，戰死。郭汜被他的部將伍習殺死。
建安三年，朝廷派謁者僕射裴茂持韶書命關中諸將段煨等人討伐李催。滅其三族。任命段煨為安南將軍，封閔鄉侯。
建安四年，張楊被他的部將楊醜殺死。任命董承為車騎將軍，開府。
自從遷都許之後，曹操掌權，天子自顧不暇，百官都是充數而已。獻帝恨曹操專權逼迫，於是秘密下詔給董承，讓他結交天下義士共同除掉曹操。董承就和劉備一起謀劃，還未動手，碰上劉備出征，董承又和偏將軍王服、長水校尉種輯、議郎吳碩合謀。事情洩漏，董承、王服、種輯、吳碩都被曹操所殺。
韓遂與馬騰自從回到涼州，戰爭不斷，攻下隴地佔據關中。曹操當時正對付河北，怕他們乘機作亂，建安七年，就讓朝廷封馬騰徵南將軍，封韓遂徵西將軍，均開府。後來徵召段煨為大鴻臚，段煨病死。又徵召馬騰為衛尉，封槐裡侯。馬騰應召而去，留下兒子馬超帶領他的部隊。建安十六年，馬超與韓遂以關中地區反叛曹操，曹操擊敗了他們，韓遂、馬超敗逃，馬騰因此被減三族。馬超又攻殺涼州刺史韋康，再次佔據隴右。建安十九年，天水人楊阜擊敗馬超，馬超逃到漢中，投降了劉備。韓遂跑到金城羌地，被其部下殺死。當初，隴西人宗建在抱罕，自稱「河首平漢王」，分封百官三十多年。曹操就派夏侯淵攻打宗建，斬了他，涼州全部平定。
論曰：董卓當初本性兇暴強悍，因為趕上天下動亂的形勢，所以得以踐踏常理，禍害天下，以他那種剖腹取拔斷人腳歷的殘忍性情，則殺盡天下蒼生也不能滿足他的快意，然而尚能謙抑對待官紳士人，也並未決心對皇室欺凌篡奪，還算存有盜賊之道。到後來賊寇又乘勢作亂，翻山倒海，烈火毒焰，從此而燃，天下動盪，至此達到頂點。嗚呼，人活著真難啊！天地真是太不仁德丫啊！
贊曰：逢百六陰極註定厄運，國家失度小人得志成災禍。董卓罪惡滔天，天怒地憤人怨。天下崩潰沸騰，京城烽煙滾滾。多行無禮雖殃及自身，遣下禍患卻隨之蔓延。流矢飛到天子車旁，刀兵環繞皇家宮闕。天下動盪，入神不寧。