——旺角區。
——油尖區。下設2個分割槽：油麻地分割槽、尖沙咀分割槽。
——九龍城區。下設3個分割槽：九龍城分割槽、何文田分割槽、紅勘分割槽。
四、新界北總區
新界北總區位於深圳與香港交界地，深港陸上邊境長達23公里，阻止並拘捕非法入境者是該總區的一項重要工作。該總區共分為4個警區、12個分割槽或警署。
1.總區總部。
組織架構與港島總區同。
2.警區及所轄分割槽、警署。
——邊境區。下設3個分割槽：落馬洲分割槽、打鼓嶺分割槽、沙頭角分割槽。
——元朗區。下設3個分割槽1個警署：元朗分割槽、天水圍分割槽、流浮山警署、八鄉分割槽。
——大埔區。下設2個分割槽：大埔分割槽、上水分割槽。
——屯門區。下設3個分割槽：大興分割槽、屯門分割槽、青山分割槽。
五、新界南總區
新界南總區位於新界北和東、西九龍之間，共分為3個警區、8個分割槽。區內特殊場所及單位有：大帽山郊野公園，沙田馬場，車公廟，白石越南船民羈留中心，大嶼山寶蓮寺大佛，赤躐角機場。
1.總區總部。
組織架構與港島總區同。
2.警區及所轄分割槽、警署。
——荃灣區。下設2個分割槽：荃灣分割槽、梨木樹分割槽。
——葵青區。下設2個分割槽：葵涌分割槽、青衣分割槽。
——沙田區。下設4個分割槽：沙田分割槽、田心分割槽、水瀝源分割槽、馬鞍山分割槽。
六、水警總區
水警總區負責管轄全港1850平方公里的水域和分佈在香港周圍190公里海域內的大約240多個島嶼的社會治安。總區機構由1個總部、1個反走私特遣隊和1個離島警區組成，由1名職級為總警司的總區副指揮官協助指揮官管理。
1.總區總部。
水警總區總部分為兩個部門：行政及支援科、行動課。
——行政及支援科。由1名總警司掌管，負責水警總區的一般行政工作。下設2個課：(1)行政課，內設3個組：行政組，社群關係及職員關係組，文職人員支援組。(2)支援課，內設4個組：支援組，海事訓練組，輪機組，訓練組。
——行動課。由1名高階警司掌管，負責執行各類治安及保安行動。下設3個組：(1)行動組，內分6個小組：總區指揮及控制中心，小艇隊，後勤組，總區運輸辦事處，總區槍房，靶場。(2)大鴉洲船民中心組。(3)總區罪案調查總部，內分2個小組：總區罪案組，總區支援組。
2.反走私特遣隊。
3.警區及所轄分割槽、警署。
——東水域警區。由1名高階警司指揮。下設2個分割槽：北分割槽，東分割槽。每個分割槽均配備若干船艇，大至40米長的指揮輪，小至10米長的巡邏艇，主要任務是執行阻截非法入境、反走私及一般的水警工作。
——西水域警區。由1名高階警司負責，下設3個分割槽：南分割槽、西分割槽、港口分割槽。
——離島區。由1名高階警司掌管，負責香港西南水域中除大嶼山和赤躐角機場以外的離島的警務工作，包括坪洲、長洲及南丫島等。
4.水警訓練學校。
由一位警司掌管，並由一組有遠洋輪船船長或專業工程師資歷的警察訓練主任協助。該校訓練專案分為30多個不同課程，並根據學員的知識和技能，各頒發三種程度的水平證書。
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