洪武三十年三月，皇帝於清明時節前往孝陵拜祭皇后，歸來後又往皇后生前經常遊玩之太平鎮緬懷往事，連日舟車勞頓加上舊疾復發，遂下旨由皇太孫全權監國，曰：可在奉天殿理政。
這可是莫大的恩寵，一般東宮監國，大都是在文華殿理政，最多移至奉天殿偏殿署理政務，朱允炆能夠在奉天殿理政，也算是皇帝的一種倚重和妥協吧，當然，皇帝的寶座朱允炆還是沒有資格踏足，只是在帝位的左側近處另設一座，但沒有了皇帝在背後如針尖鋒芒，朱允炆處理事情也安心了許多。
被禁足在府中旬月的劉三吾上書請罪，翰林院張信等人也都上書請罪。本欲和稀泥的朱允炆面對這些自以為很有風骨的文人也是無可奈何，雖然這次逼迫老朱的主旨不是救他們這些人的性命，但是也算是花了一定的功夫，現在雲開月明的時候，為什麼還偏偏的這樣不識時務的請罪呢？這不是逼自己認錯，逼老朱殺人嗎？
深知文人心理的黃子澄用一句話就解開了皇太孫的疑團：「諸人不願陷殿下於不孝、不義之名矣！」。
在大殿之上，雖然百官無言，但是誰都能看出皇上的心思是要殺人，而皇太孫為了救人則不惜祖孫差點翻臉，最後雖然挽救成功，卻也惹的皇上十分不愉，而劉三吾等人都是認為是自己惹的皇上祖孫反目，以文人的迂腐，當然把過錯都攬在自己的身上，不惜求死來成全皇家的和睦如初。
啼笑皆非的感覺充斥著朱允炆的心理，這算是什麼邏輯，不過由此，他對這班文人也產生出一種戒心，動不動就用自己的性命來成全這個，成全那個的，對於皇帝來說也算是一種威脅，而這種人又不是什麼貪官，殺之無名，不但成就其一世清譽，而且把自己的形象也給玷汙了。
正在束手無策的時候，《大明週報》總編解縉前來覲見，同時帶來了由蘇州六藝書院主事方孝孺所寫的一份稿件，題目是《論歐陽文忠公之說》，主要內容圍繞著前宋歐陽修對於科舉取士的理解所有感而發。
東南俗好文，故進士多；西北人尚質，故經學多。科場東南多取進士，西北多取明經……。
在黃子澄、解縉等人的講解之下，朱允炆才知道事情的來龍去脈，所謂「明經」考試是以記誦經文為主，而「進士」除重文辭之外尚須發明經文的涵義（經義），二者之間難易不可同而語。
歐陽修堅決主張「國家取士，唯才是擇」的原則，有一部分因為他是南人的緣故。所以他還抱怨西北士人的機會高於東南士人十倍。才有「科場東南多取進士，西北多取明經。東南州、軍進士取解，二三千人處只解二三十人，是百人取一。……西北州、軍取解，至多處不過百人，而所解至十餘人，是十人取一；比之東南，十倍假借之矣。」之說。
後來王安石改革科舉，廢去「明經」，併為進士一科，考試一律以「經義」為主。
這一改制更不利於西北士人，因而引起爭議。雖然王安石說：「西北人舊為學究，所習無義理，今改為進士，所習有義理。……今士人去無義理就有義理，脫學究名為進士，此亦新法於西北士人可謂無負矣。」
學究即「學究一經」的簡稱，指「明經」而言。然而這樣一改，西北士人在科舉考試中的機會更少了，他們是不可能接受這一辯解的。當時為西北士人說話的是司馬光，他強調：「古之取士，以郡國戶口多少為率。今或數路中全無一人及第，請貢院逐路取人。」
「全無一人及第」的當然是西北諸路。司馬光是史學家，熟悉東漢和帝時期「孝廉」與人口成比例的規定，因此援以為據，重新提出逐路取人的原則。他在元佑主政期間，盡除王安石的新法，終於為西北士人爭取到科舉制中的名額保障：哲宗以後，齊、魯、河朔諸路都與東南諸路分別考試。歐陽修「國家取士，唯才是擇」的原則從此便被否定了。
當時的西北諸路「全無一人及第」和今日的「所取盡是南人」何等的相識，但是方孝孺在文章中只說了「進士」每出於東南，而「明經」則每來自西北，只是地域上的差異，而非考生資質或者考官不公的結果。
間接和了稀泥，大概意思就是大家都沒有錯，錯的是蒙元侵我中原西北，將文化差異拉的越來越大了，雖然沒有指出什麼，但是其中的意思朱允炆已經明白了。
命解縉將方孝孺的文章刊發，並附上皇命徵詔進言，也就是圍繞著方孝孺的文章展開討論，目的有兩個，第一，可以藉助方孝孺的名聲壓制南方士子的反彈，第二，可以轉移眾人的注意力，使其不再關注於科舉風波上。
這手乾坤大挪移耍的相當成功，南方士子由於方孝孺的文章，漸漸降低了對北方士子的抵制，而同樣，北方士子看到南方儒林的精神領袖都出面為自己北方辯解，當然也無話可說，雙方遂放下對峙，把精力放在往《大明週報》投稿上面。有言語上的衝突轉為筆尖上的較量。
就這樣，科舉風波在如雪花般往《大明週報》編撰部飛去的過程中漸漸消融，洪武三十年五月，經皇上御準後，皇太孫代為下詔，曰：
大明科舉會試正式修改成南、北、中三卷；每百名士子中南卷取五十五名、北卷三十五名、中卷十名。所謂「中卷」主要包括邊遠諸省，四川、廣西、雲南、貴州。這和東漢和帝降低邊郡「孝廉」的人口比例，先後如出一轍。
地區的平均分配不但是會試，而且也同樣應用在鄉試上面；因此各省名額大致根據人才多寡而有不同，但即使文化、經濟最落後的地區，也依然有最低的名額保證。
詔令上並說，皇上感念士子十載寒窗，不忍傷士子報國之心，今科施恩，在所取南卷錄取五十一人的情況下，特許今科按照比例，從北卷中再錄三十一人，從中卷中錄九人作為褒獎，僅此一次，下不為例。
南北雙方士子皆大歡喜，南方士子沒有損失，北方士子也如願以償，不過朱允炆也沒有放棄暗箱操作的機會，在錄取中，被鄭九成引至奉天殿作證的王恕﹑焦勝二人，以及暗中帶頭起鬨的韓克忠﹑蘇文、張麟、王原等等在他的操作下全部名落孫山，被選拔出來的，大部分是內廠發展出來願意效忠東宮計程車子。
朝野上下一片和諧，就連在深宮養病的朱元璋，聽到孫兒的奏報，也是很欣慰的笑了笑，吩咐朱允炆，每份《大明週報》刊發，要給他送到宮裡看看，之後，就陪著李賢妃等人下棋或者喝茶聊天了。
可就是在這一片和諧中，也透露著一些不和諧的因素，為了回報老朱的配合，朱允炆決定對於郭英只是做了除去其軍職的處罰，並降俸一等作為懲戒，彈劾郭英的御史裴承祖接到皇太孫的告誡後採取了息事寧人的態度。
可偏偏就是出自於東宮門下的景清卻是不依不饒的糾纏著不放，雖然沒有再奉天殿上發難，但是在東宮求見時，當著黃子澄、齊泰和前來拜見皇太孫的中山王府徐輝祖、徐增壽兩兄弟，直接開始向朱允炆發難，矛頭直指皇太孫為皇親遮掩，絲毫沒有顧忌有旁人在側和君臣的名份。
就連在下首侍候的傅雍和葉孝天二人也看不過去了，景清是洪武二十五年就跟隨太孫殿下，所表現也是中規中矩，曾經被譽為太孫殿下的筆桿子，犯得著為了彈劾一個明知道皇上在護佑的侯爺，而和太孫殿下紅臉嗎？
但是景清卻好似沒有這樣想，言辭激烈處，簡直讓一干臣子感到汗顏，要不景清一個言官的身份，估計直接用個罔上的罪名就可以直接打入天牢了。
「臣就不信大樹難撼！陛下以猛治國，疾惡如仇，登基以來對於貪官汙吏絕不姑息，絲毫不含糊，只要觸犯大明刑律，不論尊卑，懲處不怠。武定侯郭英私蓄數百家奴，擅殺無辜，收受賄賂，按律當斬，皇上一定會秉公論處。太孫殿下極力維護，是何道理？」
齊泰在一邊忍不住善意的提醒道：「景御史，你別忘了，這可是皇親會議的公斷，並有陛下的御筆批示，你縱算質疑，怎麼能質疑道殿下身上呢？」
「我並未忘記。但也深知，那班皇親之所以為所欲為，癥結正在於此，所謂有恃無恐。無論大明刑律如何苛嚴，彼等哪裡看在眼裡？犯了法又能怎樣？只要不謀反，不篡權，六部三司誰敢擅逮？一律由皇親會議論究呈皇上聖裁。那些皇親各有陰私過失，自然結成一氣，互相包庇，並且秘而不宣，藐視天下臣民。」
「景御史，你不要太過分，在東宮這裡頂撞殿下，難道你真的不把皇威放在眼裡嗎？」那邊黃子澄也忍不住出言斥責道，和齊泰一樣，兩人皆以官職稱呼，也可以說已經不把景清當成東宮舊臣了。
但是景清依舊堅強不屈，終於把在一旁沉默的朱允炆給惹火了，東宮內調教出來的官員，誰知道反咬一口，和自己對著幹，光是黃子澄在場還好，徐輝祖和徐增壽兩兄弟也在場，剛剛接觸兩兄弟還沒有深談，就被景清過來破壞了興致。
看見景清還在那裡喋喋不休，舌戰齊泰和黃子澄二人，不由的一陣火氣升騰，將手中的茶杯狠狠的擲了出去，正巧砸在了景清的頭上，滾燙的茶水澆在臉上，再加上額頭被砸破的傷口血跡斑斑，在場的諸人一下子都驚呆了。
朱允炆指著景清的鼻子罵道：「給孤王滾出東宮，若是再饒舌半個字，孤王一定將你打入天牢，永世不得翻身。」
景清那留著血的眉頭一聳，似乎還是不服氣，嚇的和他一起進入東宮的葉孝天一把捂住他的嘴，將其拖了出去，不過稍等片刻，牆外又傳來「臣不服……。」的呼喊聲，但總歸是進不來了。
朱允炆臉色一片鐵青，半天沒有恢復，徐輝祖和徐增壽二人倍覺尷尬，最後還是在齊泰和黃子澄二人的引導下，正巧戶部尚書鬱新奉召來到，才漸漸進入正題。
原來，朱允炆召見徐氏兩兄弟和鬱新前來文華殿，是想了解一下關於私茶危害的問題，順便想讓兄弟二人為主事，查禁私茶事宜。
拋去剛才的不愉，朱允炆坐定後，吩咐給其餘幾人賜座，一起了解私茶的產生源頭。將近五十歲的戶部尚書鬱新受寵若驚，他和儲君向來無什麼來往，而且其手下的卓敬卻是東宮中人，正在擔憂又朝一日被取代。現在能夠得到太孫殿下的垂詢，也算是他官位穩固的一個象徵吧。
「臣鬱新叩謝太孫殿下。」坐之前，鬱新突然來這麼一手，搞的徐氏兄弟二人很不自在，也不知道該不該效仿。反而是皇太孫為他們解了圍，說道：
「罷了，你坐下吧。諸位愛卿都坐下吧，今日是在文華殿上，大家不必拘禮。」
「謝太孫殿下賜坐。」
「鬱愛卿……。」朱允炆揉揉剛才因為生氣而皺的發緊眉頭，看著鬱新說，「孤王叫你來，是要問以愛卿看來，茶禁鬆弛的根諦何在？為什麼茶法嚴厲竟有私茶出境不斷發生？」
鬱新見朱允炆面色嚴峻，他不知道剛才發生了什麼事情，還道是為了自己戶部的失職。心中發毛，作為戶部尚書，私茶出境猖獗他有直接責任，如果認真起來，罷官事小，弄不好還要刑杖加身乃至斬首棄市。他趕快站起躬身一禮，奏道：
「太孫殿下英明，皇上從洪武十五年就可使屢申茶禁，近年來微臣馭之無方，查勘不力，致使茶販恣狂不法，懇請陛下責罰罪臣！」