有人說：「如果沒有天皇不行的話，就用木雕一個，或以金鑄一個，。把活的天皇流放天別的地方去，省得惹麻煩。」有人哀嘆道：「鳳凰生末世，落魄亦堪悲；雉雞遭野火，被逐無巢歸。」這時，天皇朝廷勢力式微，形同小諸侯一般。
而後龜山天皇，此時也在京師，當初日本南北朝統一之後，足利義滿並沒有履行自己聳初的諾言，即仍舊恢復大覺寺派與持明院派天皇迭立的傳統。南朝的皇族、公卿、將士異常憤慨，後龜山天皇也後悔不迭。南朝的皇室後裔和臣子們為了恢復舊業，不斷地進行著努力。足利義滿在時他們還在暗中進行。但是現在足利義滿病重，足利義持年輕，而日本又遭到即將被滅國的危險，南朝的皇室後裔和臣子們也在不斷的準備著將幕府推翻的打算。只是時間沒有到而已。
有大明水師的協助，徵日陸軍推進的很快，日本瞬間陷入了崩潰的邊緣，大軍一直往北攻去，不出旬月。就行軍至距離京都百餘里的地點。由於後方戰線拉的過長，而逃到各處的日本武士又頗為難纏。經常出其不意的從樹林或者是山坳中跳出偷襲，殺了人立即有遁入山中林中。
為此不得不駐紮下來，清掃殘餘的日本武士，才能使日本北方獲得片刻的喘息之機，但是京都已經是一片慌亂，天皇和幕府終究不敢再留在京都，已經商議前往奈良，坐船趕往位於神奈川縣鎌倉暫時避禍。一時間，京都內人心惶惶，很多武士為幕府的這一舉止感到恥辱。
足利義滿怎麼也想不到，他一直和大明保持善意，就不同意同大明為敵，還不惜以囚犯充當僂寇送到大明表示誠意，大明的皇帝從那裡來的恨意呢。現在只能逃到鎌倉足利滿兼的地盤上尋求庇估，這個時候，足利義持才感覺到事情的不妙，一面號召各路諸侯勤王保護天皇，一面開始遣使往朝鮮，希望能尋求援兵。
日本天皇和足利幕府決定往鎌倉方向暫避的決定，的確做的時機不是很好，嚴重打擊了日本的軍隊計程車氣，可是這個決定做的也是十分艱難。第一，各守護國現在依然為著自己打算，雖然派出了部分兵力，但是絕對精銳還是留在了自己的地盤。
還有一條，今川了俊在足利義滿病危的情況下，堅決的從鎌倉趕來，要求天皇往鎌倉暫避，有沒有私心先不說，其中有一條，就是想用距離拉長明軍的戰線，意圖各個擊破。這一條得到了大家的一致認同，所以也顧不得名譽問題了。
他們認為，日本人民還是會擁護天皇的存在，只有最大限度的拉長戰線，才能尋找機會，那時候民眾都會被調動起來。屆時在給明軍致命一擊，只要失敗一次，大明徵戰在外的勢頭就會減弱，再來侵略日本就很難了。
他們是這樣想的，就這樣做凹品犬明不費吹灰點力進入了京都，控制了附斬地區後，聯。漢以及參謀部請示下一步的行動。
而南京，在建文九年初，也出現了一件十分意外的事情。二月二十日朝會，皇帝在朝堂之上宣召了張宇初、周玄樸等十二名道教名宿，重新欽定了降聖節的合法化，降聖節是唐武宗將道教太上玄元皇帝老子李耳的降誕日，也就是二月二十五定為降聖節，全國休假一天；在鐘山設道場，修築望仙台待秋後大祭。
這一訊號，給天下臣民指明瞭一條道路，那就是皇上要尊道抑佛了。
降聖節之後。皇帝諭旨，裁併天下佛寺。天下各地上州留寺一所，若是寺院破落不堪，便一律廢毀；下州寺院全部拆廢，不許重建。
人口過五十萬的城市允許保留十寺，每寺留僧三十人。天下各地拆廢寺院和銅像、鍾磐，所得金、銀、銅一律交付官庫，鐵則交付本州鑄為農器，還俗僧侶各自放歸本籍充作百姓，不許入道教修行。如非大明僧人。送還本處收管。
禁止私自出家；訂立嚴苛的出家條件，並規定必須在京師的戒壇受戒，否則無效；不許建立寺院或蘭若，違反的僧尼，課以嚴刑；未受敕額的寺院，一律廢毀；民間的佛像、銅器，限五十日內交由官庫，如果私藏五斤以上的，即構成刑事。
朱允墳藉助戰事的爆發。迅速的抑制佛教以及其他教派的擴充套件，奉道教為國教，同時由於《道藏》在蒙元時，除了《道德經》之外，基本道教經典都被焚燬。又命令張宇初、張宇清、周玄樸為首的正一教、全真教等道教宗派開始編修《道藏》。以為依據。
這個，舉動，遭到了一些佛教信徒的抵制，作為朝廷禮部所管轄的僧錄司，受到了來自於全國各方面的壓力，特別是以先皇就曾經出家為由，對於皇上的這次決定感到不滿，不過也的確無法指責，朱元樟曾經在皇覺寺出家的事情天下皆知，自己登基卻要抑制佛教，基本有些說不過去。
於是，大明首次的佛道爭辯實施就勢在必行，對於此，朱允煩有些擔心，因為蒙元時期的抑制道教，忽必烈曾經詔諭天下：焚燬除《道德經》外所有的《道藏》偽經。詔令下達第三天，《道藏》所謂的偽經全部集中到憫忠寺，在朝廷官員和佛教四眾弟子的監督下全部焚燬。
所剩下的道家典藏本來效名經不多了，總不能讓張宇初等人靠著《道德經》去和佛教辯論吧。
朱允墳這才發覺自己忽視了佛教千餘年來積累的底蘊，已經漸漸的在民間甚至官府有了一定的影響力，再加上蒙元時期的可以宣傳，暗藏在裡面的力量不可小看。
但是佛道之爭辯勢在必行，自己作為皇帝，也不能太過於表面上偏袒，於是下令張宇初首先搜尋《老子化胡經》的下落，首次爭辯就從其的真偽上展開，另外，丟擲門戶派別之見，集合道教所有力量全力編撰道藏。主張吸收全真的教戒，提倡艱苦儉樸之風，以達到振宗興教的目的。認為修道之士應以戒行為先，遠離塵俗，草衣木食，以真功苦行磨勵身心，宮觀要加強管理，住持以精嚴戒行而服為，不得結交權貴、干預公事、私蓄俗眷。道藏按照張宇初的建議，以三洞、四輔、十二類的分類進行編撰，採用《千字文》為函目。三洞即洞真、洞玄、洞神三部，系承襲陸修靜《三洞經書目錄》題名。
四輔即太清、太平、太玄、正一的總稱，是對三洞的解說和補充。據《道教義樞》及《雲笈七籤》的記載，太玄為洞真經之輔；太平為洞玄經之輔；太清為洞神經之輔；正一部通貫三洞和三太即太清、太玄、太平，遍陳三乘，為以上六部之補充。
三洞之下各分十二類總為三十六類經亦稱三十六部。即本文類：經教的原本真文；神符類：龍章鳳篆之文，靈蹟符書之字；玉訣類：對道經的註解和疏義；靈圖類：對本文的圖解或以影像為主的著作；譜錄類：記錄高真上聖的應化事蹟和功德名位的道書；戒律類：戒規、科律的經書及功過格；威儀類：齋法、瞧儀及道教科儀制度的著作；方法類：論述修真養性和設壇祭煉等各種方法之書；眾術類：外丹爐火、五行變化和一切術數等方術書；記傳類：眾仙傳記、碑銘及山讀道觀的志書；讚頌類：歌頌讚倡的著作，如步虛詞、讚頌靈章、諸真寶誥等；章表類：建齋設蘸時上呈天帝的章奏、青詞等。
務求在三年之內編幕完成，屆時無論是日本戰事，還是帖木兒、朱橡等北方事務都基本會有個結果，民眾的注意力自然會回到這些瑣碎事上來，對於佛道之爭的結局也肯定會更加關注了。
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