那次討論會結束後，孫元一花了三天的時間，把圖冊裡所有的圖片都仔細研究了一遍。除了個別幾幅影像外，他已經理解了幾乎所有影像的含義。其實這並不難，運用歸納法，將圖片分類後，很容易就可以看出這些影像中隱藏著的一致性，以及其慣用的表達方式。
這些圖片大致可以分為兩類。一類是表現物質的存在形式，一類是表達某種科學定律。比如之前會上討論的那些電子結構圖就是第一類，而表達勾股定理的三角形則屬於第二類。孫元一發現，不僅那些對物質結構的描述錯誤百出，很多科學定律的表達也非常荒謬。光是物理學方面，就有不下二十個明顯錯誤的定律。比如能量均分定律、分子微觀壓強、聲速與介質的關係，甚至連最基本的萬有引力定律都是錯的——根據影像上的描述，引力竟然與距離的一次方成反比！
他越來越迷惑了，難道這一切真如那位首長所說，是外星人用來誤導人類的嗎？可他又隱隱覺得，在這些影像中，有著某些隱藏著的、呈現出規律性的東西。比如，在所有的電子結構圖中，原子的第二層電子都是六個——這恐怕不是胡編亂造，其背後是否反映出了某種我們並不理解的電子結構規律呢？他不免這樣設想。
因為，在某些特殊的環境中，原子的外層電子結構確實會發生改變。比如在某些特殊的晶格結構中，或者在強烈的磁場中，電子的排布方式並不完全遵循通常的順序：在第二層沒有排滿的情況下，它們的核外電子會先去排布在第三層軌道上。
孫元一開始認真地考慮起這種情況，有沒有可能，這種外星智慧生物的生存環境極其特別——比如存在著強烈的磁場——從而使得在它們的世界中，核外電子的排列順序與我們熟知的不同呢？或許，它們傳遞這樣的核外電子排序方式，正是想向我們傳達其所處環境的某些資訊呢？
想到這裡，孫元一立刻動筆演算起來。他一一計算了在各種特殊的物理環境中，原子的電子結構的變化情況，然後逐一和碑文上的影像進行對比。有一次，他計算鈉原子的電子排布方式還真和碑文上的結構一致，可在同樣的情況下，其他原子的電子排布結構卻又完全和碑文對不上。
面對這樣的情況，他只能不停地計算，不停地對比，不停地思考還有些什麼特殊的環境會對電子排布產生影響。不知不覺中，當房間昏暗到孫元一看不清紙上的波函式公式時，他才恍然發覺，自己已經在辦公室裡計算一整天了。在自己的右手邊，雜亂疊起的驗算紙已經沒過了自己的胳膊。在辦公桌上，還放著一碗早已經變涼的豌豆麵，應該是某個同事給自己送來的午餐，可是自己對此卻完全沒有印象。
更糟糕的是，在他能想到的所有情況下，大部分原子的電子排布方式都和石碑上的結果有著巨大差異。他提起筆，在紙上寫下一個表示波函式的希臘字母，在後面加上等號，可等號之後，他卻久久無法寫下新的字母或符號。
這時，房間的門突然被推開，孫元一抬頭一看，一個扎著雙馬尾的小女孩正怯生生地站在門口。這女孩是一個同事的孩子，經常帶到辦公室來寫作業，稚氣的模樣非常可愛。
「找你爸爸嗎？」孫元一見她一直不說話，便開口問道。
小女孩點了點頭。
「你爸爸應該快下班了，先坐那兒等一會兒吧。」同事是一個電氣工程師，最近因為各種突發事件，常常加班到深夜。這小女孩就在附近的一所小學上課，放學後家裡無人照管，所以總來這裡一邊做作業，一邊等著爸爸下班後一起回家。
小女孩「嗯」了一聲，便來到孫元一旁邊的位置上坐好，從書包裡拿出一本作業冊，開始寫了起來。孫元一開啟辦公室的燈，坐在一旁，看著天邊緩緩西沉的落日發呆。
不知何時，小女孩來到了孫元一的身旁，拽了拽他的衣袖。孫元一這才回過神來，看見小女孩拿著作業冊，指著一道題目說道：「叔叔，這道題我不會做……」