因為苗沛霖正苦監視太嚴，動彈不得，經勝保檄調到陝，恰好給了他一個竄擾的機會。於是軍機處搞得手忙腳亂，用六百里加緊的廷寄，「嚴飭勝保速行阻止」，同時分別命令僧格林沁及有關各省的大員，阻攔苗沛霖，「妥為開導，剛柔互用。如不聽阻止，即著分撥兵勇，併力兜剿，毋許一人一騎，鬧入境內。」
這還不算，還把苗沛霖的一個「剋星」找了出來。這個人就是湘軍羅澤南的舊部李續宜，一向在皖北打仗，地形極熟，苗沛霖對他相當忌憚。後來調到湖北，當胡林翼病重時，專折保薦他接任，不久，由湖北調為安徽巡撫，用意就在責成他專門對付苗沛霖。到任不久，丁憂奏請開缺，朝中不肯放他，只准假百日，尚未期滿。現在因為勝保的荒唐，怕苗沛霖蠢動，所以特旨催促，「剋日啟程赴皖任事，斷不可拘泥假期未滿，稍涉遲延，致皖省大局，或有變遷貽誤。」
為了勝保的輕舉妄動，惹起了極大的麻煩，朝中大臣，各省大吏，無不對他深恨痛絕，「皆曰可殺！」
於是各處彈劾密告勝保的章奏文書，又如雪片飛到。恭王派了專人處理，把那些檔案分別處理，雖有少數誇大其詞，意在報復的，但大致都可信其實在，因為一項劣跡，常有幾個人指出，經過仔細比對，逐條開列，總計有十來款之多。
為了整飭紀律，軍機大臣沒有一個不主張嚴辦的。第一步當然是查明實在情形，可是怕打草驚蛇，勝保得知其事，激出變故，而且正派他負責剿平回匪，也不能打擊他的威信，這樣就不便公然遣派大臣查辦。
會商的結果，採納了文祥的主意，向僧格林沁查問，奏準兩宮太后，隨即下了一道密諭：
「前有人奏：勝保去春督師京東，以至入皖，入陝，所過州縣，非索饋千金或數千金，不能出境，稍有羈留，官民尤困。隨營之妓甚多，供億之資不少。又有人奏：勝保上年督兵直隸，路過衡水，悅民間女子，招至營中閱看。又縱容委員，濫賣‘功牌’，至今直省拿獲馬賊，多帶有勝保營中藍翎或花翎，以及頂戴執照。又有人奏：勝保以一寒士，自帶兵以來，家資驟富，姬妾眾多，揆厥由來，總由濫保人員，以取賄賂；虛報名額，以冒口糧；勒派捐稅，以充私囊。本年督兵赴皖，挈帶眷屬，熄赫道路；其拔營赴陝，同行女眷大轎有數十乘，聞」四眼狗「陳玉成家眷，亦為勝保所有，隨從車輛，不知多少？各州縣不勝苦累等語。以上勝保貪漁欺罔各劣款，系近日節次有人參奏，情節大同小異，似非虛罔。僧格林沁久駐河南、安徽交界處，見聞自必較確，著即按照所參各款，據實復奏。」
以外還有陝西紳士的「公稟」——是由多隆阿抄呈的。這些公稟是要求多隆阿回陝西去平回亂，當然也就提到了勝保，除去貪汙、好色的劣跡以外，還指出「諱敗為勝」，說渭河北岸，「匪巢林立」，西路鳳翔，東路同州，為回匪集結之處，而勝保安坐省城，捏造獲勝的戰報。朝中這才明白，中原的局勢，比想象中要嚴重得多。
整個情況是四面作戰，剿捻匪、平回亂、對付勝保，還要攔截苗沛霖。這些任務，分別落在僧格林沁和多隆阿身上，而急務是不準苗沛霖入陝，怕在回亂以外，別生「苗亂」。
朝中的佈置是以僧格林沁為第一線，這一線在河南如果擋不住苗沛霖，那就要靠多隆阿扼守潼關。此地自古就是一夫當關，萬人莫敵的重險，多隆阿如果不能及時趕到，後患不堪設想。
而多隆阿的全部兵力不到七千人，從紫荊關北上，且戰且走，星夜疾馳，趕往潼關。
這時的勝保，到同州、朝邑一帶視察了一番，已經回到西安，還在要兵要餉。親自動手的奏摺，已不是「非朝廷所能遙制」的話了，改了一個說法：「先皇帝曾獎臣以‘忠勇性成，赤心報國’，」這是指英法聯軍內犯時，勝保曾在通州「與洋人接仗」而言。接下來便鋪敘他這次同州之行的戰功，說是一個名叫王閣村的地方，為回匪老巢，進剿大勝，得意洋洋地寫道：「臣抵同未及三日，獲此全捷，差可壯我軍威。」然後就提到軍餉了，除了照例指責各省協餉，未能如數撥解，兵勇口糧，積欠累累以外，因為關中已是「西風吹渭水，落葉滿長安」的季節，特意加了一筆：「現在天氣日寒，兵丁時虞飢潰。」另外加了三個「附片」，一個是參奏署理陝西藩司劉齊銜籌餉不力，辦事翫忽；一個是奏請開復三名革職人員的處分，隨營效力；再一個是請催新任西安將軍穆騰阿迅即赴任，並幫辦陝西軍務。
等這個奏摺到京，僧格林沁奉旨查明勝保劣跡的復奏也到了，不但上諭中所指出的幾條，都是事實，另外還查出了許多秘密。最駭人聽聞的是，陳玉成的兩個弟弟被捕送到勝保軍營，獻上金銀數千兩之多。勝保得了這麼一筆豐厚的賄賂，全力庇護，饒了那兩個「要犯」的命，並還派在營裡當差。
這個秘密的揭露，為軍機大臣帶來的隱憂，不下於勝保的擅調苗沛霖入陝。當即以緊急驛遞，分飭僧格林沁和多隆阿遣派專人訪查詳情，同時再一次催促多隆阿星夜兼程，說他早一日到潼關，便可早一日「抒朝廷西顧之憂」。
潼關當然有人在坐守，那是署理陝甘總督熙鱗，他的任命，在七月間與勝保的任命同時下達。陝甘總督駐蘭州，赴任途中奉旨留在陝西處理回亂。西安有了一個跋扈異常的勝保，還有身為「地主」的巡撫瑛棨，他不便去自討沒趣，因而留在潼關。堂堂總督，侷促一隅之地，而勝保有所知會，動輒以硃筆下札，把他的身分貶成了一個總兵，因此，這個老實人抑鬱萬狀。但總算是一個總督，所以軍機處所發的，有關指示處置勝保的密旨，大致他也有一份，跟恭王和軍機大臣們一樣，他日夕所盼望的，也就是多隆阿早到潼關。
多隆阿終於在十一月十九，依照他自己所預定的期限，領兵到了。這是一支好軍隊，因為多隆阿軍令嚴肅而馭下有恩，所以連營十餘里，闤闠不驚。在潼關，他除了會見熙麟以外，還特地找了個人來會面——駐紮黃河對岸，山西境內，自風陵渡到蒲州，沿河佈防的西安右翼副都統德興阿。