黑旗軍，最早見於中國的近現代史上，是19世紀60年代由劉永福在廣西的六安建立，因為以七星黑旗為戰旗，故叫黑旗軍。
劉永福當時所處的社會，正是中國發生三千年未有之變局的時代，清朝腐敗政府在國外侵略勢力的武力打壓下，接連簽訂了《南京條約》等一系列喪權辱國的條約。戰後割地賠款使中國的社會經濟發生了重大的變化，在侵略者和清政府的壓榨下，社會矛盾空前激化，爆發了一次次的農民起義，尤其是洪秀全領導的太平天國革命將無數分散的農民起義匯聚成中國近代史上第一次反帝反封建的革命**。
在這樣的時代背景下，又加之天災人禍的打擊（劉永福16歲那年，父母及叔父因貧病交加先後不幸去世），劉永福的心中埋下了反抗的火種。也正在此時，反抗清朝封建統治的農民起義風起雲湧，劉永福開始尋找自己可以投奔的起義隊伍。1857年，也就是劉永福20歲的時候，他毅然地離開幾乎已不存在的家，束髮投奔天地會旗頭鄭三領導的起義隊伍。
以後，劉永福又先後投奔吳二、王士林、黃思宏、吳亞忠等農民起義隊伍。在吳亞忠領導的起義軍中，劉永福的軍事才能得到了較大的提高和發揮。也正是在這個時候，劉永福建立了「黑旗軍」，他們以七星黑旗為軍旗，並舉行了祭旗儀式。黑旗軍初創時有200多人，基本成員是貧困的農民。在劉永福的帶領下，黑旗軍屢戰屢勝，使敵人聞風喪膽、坐臥不寧。雖然劉永福領導的黑旗軍屢建奇功，經受了一次又一次嚴峻的考驗，在政治上和軍事上日趨成熟，但這時太平天國運動已經失敗，全國的農民革命正從**走向低潮。清政府為了乘勢將仍在全國各地不屈不撓堅持反清鬥爭的農民起義鎮壓下去，以消除心腹之患，下令對農民起義盡絕根誅，「不令餘燼復熾」。
與此同時，派出數倍於起義軍的清兵，採取堡壘合圍戰術，步步為首，四面進攻，圍追堵截，務求斬盡殺絕。在這種敵我力量十分懸殊的形勢下，為了儲存有生力量，劉永福率領黑旗軍向中越邊境實行戰略轉移，最後抵達六安。在六安，劉永福正式建立立了黑旗軍，以七星黑旗為軍旗，並制定了嚴密的軍事編制和嚴明的紀律。黑旗軍剷除了橫行霸道於中越邊境一帶的封建割據勢力和土匪勢力，穩定社會治安，維護百姓利益，鼓勵開墾荒地，發展農業生產，鼓勵民間正常貿易，並實行稅收制度以解決軍餉。劉永福在中越邊境所做的一切獲得了越南人民和政府的信任，這為他以後赴越抗法，赴臺抗日打下了一定的基礎。
1894年，日本挑起了對中國的侵略戰爭，甲午戰爭爆發，日本侵略臺灣。由於清政府在戰爭一開始就推行投降主義路線，中國軍隊在海陸戰場上連連敗北；而日本侵略者在海陸戰場上的輕易取勝，更進一步助長了其鯨吞整個中國的野心。日本侵略者的狼子野心讓劉永福毅然率領黑旗軍抵達臺灣抵抗日本侵略者，並駐守於臺南地區。1895年，劉永福以黑旗軍為主力，團結臺灣友軍，在臺灣轉戰臺南，臺中，臺北與日軍浴血奮戰5個月，終於重創日軍。
蕭天在大學的時候每每看到這一段劉永福在臺灣抵抗日本侵略者的時候，心中都難以抑制地流動著一種豪情，大大地感嘆現實的社會沒有給予他這個機會。蕭天也曾經無數次把自己假想為抗擊外國侵略者的劉永福，率領黑旗軍把外國侵略者從中國的領土上趕出去，也能象劉永福一樣成為萬人仰慕的民族英雄。
雖時光流轉，但情懷依舊。當時間的指標指向20世紀末的1999年，地點也是臺灣省的臺南市，蕭天也在今天正式宣佈了他的黑幫名字就叫黑旗軍，已經仙去近一個世紀的劉永福怎麼也不會想到陰差陽之下，他曾經引以為傲的黑旗軍在蕭天的手中，在20世紀的最後一年又重新建立在臺灣的土地上，領軍人物正是年近20歲的蕭天。
所謂無盡黑道，群雄崛起！
黑旗無敵，縱橫天下！
統帥黑旗，唯有蕭天！
今天夜裡，一共整合潮洲幫人馬396人，蕭天把所有人馬兵分兩路，李東，張剛率領三大金剛帶領一路，從臺南東面開始對各個幫派的場子進行掃蕩，蕭天率領水哥，火鳳，飄雪，六叔等人帶領另一路，從臺南西面開始對其他幫派進行圍剿，務必在最短的時間吞併除三聯社之外的所有幫會。
蕭天給所有兄弟下了死命令，能和平吞併就和平吞併，不能和平吞併一定要斬草除根，不給任何幫派死灰復燃的機會。
眾兄弟轟然領命後，各自帶領所轄人馬象兩條黑色的暗流象臺南市中心湧去。
廣場上還一絲絲淡淡的血腥味還在飄蕩，但是已經看不到一具屍體，所有屍體已經由蕭天命人全部清理乾淨，整個廣場的霓紅依然閃爍，月光依舊照人。
連續三天，不分晝夜的和平談判和無情廝殺。
經歷了三天的殺戮，水哥和加入黑旗軍的潮洲幫的兄弟才真正見識到了蕭天的辣手無情還有那決心一統臺灣黑道的野心，所有都慶幸在那一晚沒有絲毫猶豫地加入了蕭天的黑旗軍。蕭天的談判絲毫不拖泥帶水，甚至前一秒鐘還在和你和顏悅色。如果不歸順，後一秒鐘就可以把刀捅進你的胸膛，更讓水哥下面的潮洲幫的人感嘆的是所有幫派不管大小，竟然都沒有反抗蕭天的力量。
應該說兩路人馬分兵後，只是一百多人不到兩百人的，在臺南市一般的小幫派都能有這樣的實力。水哥看出蕭天明白自己的處境和實力，所以他第一個狙殺的物件往往都是對方的老大，更可憐的是所有老大甚至都不知道自己是怎麼死的。水哥看出說到底，凡是死在蕭天手上的各幫派大哥都根本沒有把蕭天這個毛頭小子放在眼裡，加之蕭天下手也是夠狠，手下兄弟實力強悍。當然有的幫派大哥順利收服還是依靠水哥的指引。而這些進入黑旗軍的本來還不太服氣的大哥在看到蕭天掃蕩下一個幫派的手段後，都會無一例外地感謝水哥救了他們一命。
水哥心頭苦笑道，照這樣的雷霆掃蕩，臺灣黑道總有一天都會在蕭天的掌控之下。不過好歹自己也算是開國的元老，將來自己的好處也一定會多多的。
三天的時間，沒有任何懸念，蕭天和李東的兩路人馬成功地掃除了除了三聯社意以外的大大小小的二十多個幫派，共接收臺南市區夜總會72個，歌廳、舞廳、酒樓達到上百家，以及各個幫派的黑道生意，蕭天手下人馬達到了近3000人。