由於大明在大員沒有軍隊，他們得以在大員海外的一個鯤身島（沙洲）上建築城堡，起名為熱蘭遮城（今安平古堡），從此開始為禍此地。
關於大員名稱的由來，據說是由閩南話「臺員」轉音而來。
從此，整個臺灣島，都被這些殖民者稱作「大員」，直至清朝，才正式更名為「臺灣」，並設定了臺灣府，隸屬於福建省。
這就像澳門被佛郎機人誤稱為「馬靠」一樣，只不過是一夥搞不懂漢語的佛郎機人，首次登陸的地點叫「媽閣」而已。
值得一提的題外話是，這個帶路黨，是一個與顏思齊同時期的大海盜，泉州人李旦，此人海上作風強悍，洋人都稱他為「甲必丹李旦」。
「甲必丹」（captain）一詞，是船長的意思，為佛郎機人統治馬尼拉時期，對漢人領袖的稱呼，直至很久的後來，才引申為陸軍上尉，或海軍上校。
而在此時期擔任李旦翻譯的，就是小名一官的鄭芝龍，這件事之後，鄭芝龍才正式歸附了同一年也來到臺灣的「日本甲螺」（倭寇首領）顏思齊，並很快得到重用，第二年便成為其接班人。
說起來，雖說鄭芝龍海盜習氣不改，因算計過度而晚節不保，反誤了卿卿性命，但其實此人是個大才。
他自小不喜讀書，性情逸蕩，有膂力，好拳棒，還熱衷劍術，因此不受其父喜愛。
十八歲時，鄭芝龍與兄弟們齊至濠鏡，在舅父黃程處學習經商，為其舅販賣白糖、奇楠、麝香等貨物。
在與佛郎機人打交道的過程中，他學會了盧西塔尼亞語（又被稱作猶太—葡萄牙語，今已基本失傳）和葡萄牙文，還到過馬尼拉，會說一口流利的葡萄牙話。
直至後來，他又常來往日本，由此學會了日文，居然還得到了幕府將軍德川秀忠的召見，因此受到平戶藩松浦家的優遇，並娶了其家臣田川氏的女兒為妻，即鄭成功的生母。
就這樣，咳咳，鄭芝龍居然成長為一名通曉閩南語、南京官話、日文、荷蘭文、西班牙文、葡萄牙文的語言專家！
另外，他還受舅父影響，接受了天主教洗禮，取教名為尼古拉斯，是以，洋人都稱他為尼古拉斯?一官（nicholasiquan）。
……
第二年一月，荷蘭東印度公司指派首任總督宋克抵達大員，僅用15匹棉布就騙去了臺南陸上一大片土地，建築了普羅民遮城（今赤嵌樓）作為殖民統治的中心，並漸漸向南北兩個方向擴張。
往南，他們征服原住民，佔據了打狗港（今高雄港），往北，他們以武力控制了笨港一帶（位於今臺中地區雲林縣），北港溪沿岸的移民村落。
崇禎十五年（1642年），荷軍進攻位於臺北雞籠嶼（今基隆港）的西班牙殖民軍，將其驅逐出大員，從此，全島淪為荷蘭人獨佔的殖民地。
荷蘭殖民者實行強制統治，他們不但在軍事上重重設防，而且採用極為嚴厲的政治制度來維護野蠻的殖民統治，施盡巧取豪奪之能事。
他們大肆掠奪大員的資源，把大員當時的可耕土地全部掠奪作為「王田王園」，對農民進行農奴式的剝削，強迫漢人和原住民繳納各種繁重的租稅，大肆掠奪他們出產的米、糖，並將其收購的中國生絲、糖和瓷器轉口運往各國，牟取高額利潤。
農民稍有不滿，他們便進行殘酷的軍事鎮壓，經常派兵包圍村莊，進行血腥屠殺，常常採用車裂、火燒、釘十字架等酷刑，殘酷鎮壓敢於反抗的百姓。
……