這些都沒有什麼，但是朱允墳聽齊泰的彙報，越聽心裡越是生出一股怒氣來，日本為了達到目的，不但通過行賄的手段讓部分朝臣替他說話，而且在民間，他們通過僧侶結交名士，再通過百姓對於佛教的的痴迷，和對於所謂名士的盲從。達到間接替日本宣傳的手段。
也難怪在六段時間內，朝廷上下贊成恢復「國賜」的呼聲越來越高，就連朱允墳起家所創辦的六藝學院，也仗著自己是天子門生，曾經聯名上書，請求皇上憐憫日本國小位卑，要施以教化和撫慰等等。
日本人的手，伸的也太長了吧。
朱允墳這樣想著，卻不動聲色，最後的一點憐憫也消失了，遂召見祖阿和尚和肥富覲見，一反往常的愛理不理，反而和顏悅色起來對於日本提出的貿易請求，答應給予考慮，讓他們和楊傑派出的人具體商議，然後上個奏表於朝議。
祖何和肥富大喜過望，沒有想到會有這般的好事，接著又聽皇帝定下基調，除了要日本國王年年進貢的表面文章外，還可以考慮開放寧波為專用通商港口，設為自由港，約定雙方商人可以自由往來。希望日本能夠開放坍港等地作為通商碼頭等等。
一番話說下來，祖河還沒有什麼，那肥富本來就是商人出身，那裡經得起這般誘惑，馬上就趴在地上不住的叩頭謝恩等等，朱允墳不願意看見他那種醜態，讓他們退下，由楊傑負責選擇與其身份對等的人雙方進行談判。
隨後，就召集傅雍等一眾內廠人員，開始調查大明現在的僧侶狀況。
在監國期間，朱允墳就聽說了朱元璋對於佛教有一定的情結，從幾個方面可以看出來，先就是馬皇后死後，也就是洪武十五年，朱元璋選高僧侍諸王，為已故馬皇后誦經薦福。而道衍就是那時候結識的朱橡，由此開始了另一個時空的改朝換代。
這些還不算，在他還是皇太孫時，母親呂氏也十分信奉佛教，並且勸朱允墳也要禮佛，為了使兒子相信，曾經給他講個故事，說是在姚州有個和尚叫記太璞，他專心致志地研究禪學，藏經就達五千四百卷，沒有不會背誦的，皇帝聽說後，十分感興趣，下令召見了記太璞，並十分喜歡這位佛學大師。
有一天，皇帝問記太璞：「一個人做和尚沒做到底，會得到什麼報應？」兄太璞回答說：「做和尚沒做到底，那要永遠墜落在阿鼻地獄。」皇帝又問：「出自哪裡？」記太璞說：「出自藏經第孔都御史詹同目睹紋個場景，他就開始責怪起臼太虹麼要那樣跟皇帝陛下說呢？」記太璞說：「我是一個佛教徒，我不敢違背佛教教義，也不敢欺騙皇帝陛下。」在聽完記太璞與詹同的那些對話後，皇帝再次追問記太璞，記太璞以實相告。
皇帝馬上臉色都變了，他又問記太璞：「照這樣說的話，聯應該要受到報應了？」記太璞趕緊磕頭說：「皇帝陛下您是天生聖人，是天下黎民百姓的主宰，哪能同普通人一個樣呢？」皇帝聽後，臉上馬上多雲轉晴，並好奇地問道：「你這樣的說法又出自藏經的哪一卷？」記太璞說：「出自藏經第幾卷。」皇帝朱元璋不信，趕緊叫人去取藏經來檢視，結果現果然如此。於是他龍顏大悅，召集大臣，對他們說：「諸位大臣你們雖然各自都很有才，但不如這個和尚忠誠啊。」
記太璞後來臨終前沐浴更衣，來到明皇宮向皇帝朱元璋道別，網好那天朱元璋有事外出，兩人沒碰著，妃太璞只好對著皇帝的御座叩說道：「臣跟皇帝您有生緣而無死緣。」拜完了，他站起來，回去了。後來皇帝朱元樟聽人說起了事情的整個經過和記太璞說過的話，他馬上斷定：「嗨，記太璞已經死了。」於是趕緊派人到記太璞的住處，現那和尚果然死了。朱元璋就叫人前去祭祀記太璞，而且動用了他從不輕易使用的驛路將和尚瓦太璞送回了他的故鄉。
儘管母親說這個。故事的時候十分虔誠，但是朱允墳當初並不相信。覺得母親說的太神了，哪有這麼巧合的事情。這個故事不算。但有一個不爭的事實是，老朱對佛教的迷戀似乎隨著年紀的老去而越來越重，也許正是他對因果報應的恐懼，也許是他到了晚年之際對自己一生濫殺的內心反思而引的心靈彷徨，也許是他想彌補一生的缺憾。
因為朱允墳知道，雖說朱元障力主以儒治國，但實際上朱元障是「雜家」口頭唱的是儒家的曲子，手裡拿了法家的刑具，魂系在佛家因果報應的迴圈圈裡。沒有多少宗教觀念，只是他畢竟投身過佛門對其教義要熟悉多而已，朱元障什麼都不相信，就相信自己而已。
經過月餘的內廠多方調查與論證，由於那時洪武年間先帝對佛教青睞有加，而朱允墳也未曾注意過這些，佛道在洪武的最後那麼多年有了迅猛展，它們廣佔田地，不向朝廷繳納賦稅，這在無形之中加重了百姓的負擔，最為嚴重的是洪武晚年的江南地區，許多腴汰之地被僧院道觀所佔有，個，別寺院甚至田連陣陌，橫跨數十里。
不由有些慚愧，這幾年，注意力一直放在北方，竟然沒有注意到江南的魚米之鄉出現了這麼大的一個蛀蟲，佛教這東西，朱允墳認為，只能做一個娛樂性的東西消遣，是絕對不能痴迷的，對於道衍的顧忌，他曾經下過類似限制佛教展的旨意，不過那是在監國期間，出於朱元璋的意思，自己的旨意很快的被掩埋在老朱的威風中，現在看來是要管一管這些不事生產的神棍了。
這是楊傑所派遣的鴻驢寺官員和日本使節的談判也即將結束，得到皇帝暗示，楊傑只是讓鴻驢寺官員陪著祖河和肥富等人瞎扯一通，以此來限制他們的活動範圍，以方便朱允墳調查，現在調查基本完畢，當然也不用再浪費時間了。
皇帝下詔，鑑於日本國王足利義滿的誠意，朝廷基本同意日本提出的貿易請求，但是海上盜匪、僂寇盛行，為了不影響雙邊貿易，大家要互相清剿海匪，對於日本，大明曾經做過詳細調查，知道僂寇基本都是由日本九州大內氏所主導的，現在時局不穩，商議之條件暫時擱置，大明清剿海匪，而希望日本國王再表示誠意，徹底剿滅大內氏，為雙方貿易打下基礎為盼。
也就是告訴日本，你什麼時間把大內氏滅了，咱們貿易什麼時間開始，同時，又由錦衣衛指揮使齊泰單獨接見肥富，把日本大內氏襲擊大明水師所造成的傷亡以及證據複製了一份讓他帶回本土，表示了大明對於此事的憤怒，並隱約暗示，如果日本沒有能力，大明將糾集水師，親自報仇。
沒有想到談了月餘是這個結果，肥富對於壞了日本貿易大事的大內氏竊罵不已，眼看著已經談攏的協議只能放在那裡看著，心裡充滿遺憾，但是皇帝既然定性，他也沒有辦法。只好回國之後，繼續鼓動足利義滿加大對大內氏的打擊，爭取和明朝的貿易能夠成功。
建文三年歲末，朱允墳不顧群臣的反對，下詔規定：天下寺院道觀，每僧道一人各存田五畝，免其租稅，以供香火費，餘田入官，均給平民，並且嚴令全國臣民，禁止私自剃度為僧尼，限制佛道勢力的展。
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