4月17日，締結了媾和條約。
清政府最抵制的是割讓遼東半島。清王朝興起於中國東北，進入北京之前，曾以瀋陽（奉天）為都。遷都北京後，這裡仍稱做盛京或留都。昔日的宮殿儲存下來，叫奉天故宮。郊外有太祖努爾哈赤的福陵和太宗皇太極的照陵，兩帝乃清朝的創業之主。
當日軍從朝鮮跨過鴨綠江進入遼東時，北京宮廷大驚失色，曾飛檄命令死守這塊「皇祖寢陵之地」。
日本要求割讓的北限，是遼河一線，緊貼著奉天之南。
努爾哈赤遷都瀋陽之前，都城是遼陽。根據日本的方案，遼陽在割讓之內。
遼東半島為日本所有，旅順就變成直布羅陀，使日本能控制渤海，隨時可以進攻北京。清廷認可的是割讓鴨綠江西岸以鳳凰城為中心的與朝鮮接壤的領土，但日本豈能滿足於這麼小的地塊。
關於割讓，日本準備了abc三案，提給李鴻章的是b案。a案比b案更往西擴充套件了許多。這個b案，把遼陽、鞍山劃在內，地盤也不小。李鴻章拼命抵制，日方終於讓步。其實，日本的讓步不過是「預定的讓步」而已，早就準備好了c案。
根據c案，遼陽和鞍山仍歸清廷所有。即便如此，比後來日本從俄國手裡接過來的租借地「關東州」也大七倍多。
至於賠償戰費，這場戰爭既不是中方主動攻擊日本，又不曾踏進日本尺寸之地，實在是毫無道理。何況要三億兩，五年付清，真是苛刻已極。
「不管怎麼說，太苛刻了！」李鴻章反覆唸叨，他最瞭解清政府財政的拮据。
最後日方讓步，減為兩億兩，七年付清。
日本明白，若要求過苛，清政府實在無法接受，日本就只有談崩，再挑起直隸之戰。那時，列強勢必干涉，不要說割讓土地，連分文戰費賠償也得不到。
中方只認可割讓與朝鮮接壤的四縣和澎湖列島（不包括臺灣島），賠償戰費一億兩。這是李鴻章4月9日提出的修正案。日方提出讓步方案是4月10日。
日方明知直隸作戰要冒很大風險，但到了此時也只好讓徵清大總督府的增援部隊出發了，並且有意讓李鴻章目睹這批運輸船。增援部隊於4月13日開出宇品港。
提出讓步方案的次日，4月11日，伊藤博文寫信給住在引接寺的李鴻章，限期「四日內答覆」。
兩國代表的心都處於忐忑不安之中。
李鴻章接到伊藤的最後通牒式信件，同時又收到天津的電報。是德璀琳發來的。
德璀琳是天津稅務司，與李鴻章很親近。不久前，他奉李鴻章之命出使日本，伊藤以不是正式代表為由拒絕接見。同日本媾和事宜，他很早就參與了。
電報說：「前任德國駐中國公使來電稱，列強對中國割讓領土問題頗有議論。皆認為日本要求不當，中國不必急於議和。」
伊藤首相4月12日也接到日本駐俄國公使的衝擊性電報：「俄國陸海軍聯合委員會討論了阻止日軍進攻北京的問題，結論是，以俄法聯合艦隊達成其目的。」
果然招致了俄國的干涉，法國和德國也將同步而來，伊藤和陸奧心急如焚，認為不趕快簽約，恐怕要生變。
確認增援部隊已出發的李鴻章，比別人更著急。日本是怕可能得到的東西不能到手，而清廷則是怕失掉更多的東西。
日軍進逼北京，倘若這時太平天國和捻軍還沒有被鎮壓，清王朝就可能崩潰。如今太平天國和捻軍已被李鴻章等人聯手平定了，不過，借日軍進逼北京之機，第二、第三個太平天國的出現勢在必然。
李鴻章在引接寺偶然想起去年讀過的文章。他站在政界的最高峰，時常有人向他「上書」，大都是憂慮國家前途，議論救國方法。運氣好的話，獻策被採納，獻策者就可能當上官。這類上書，李鴻章很少看，只是心血來潮時才讀一讀，但也讀不上一半便順手拋掉了。去年他讀過一篇文章，好像是個廣東青年寫的，名字叫什麼……
李鴻章沒能想起孫文這個名字。
可以明顯地看出，他確實是憂國之士，似乎對外國的事情很熟悉，常以外國作對比，提出要下決心採用外國文明等。不過，他所熱愛的國家似乎不是這個清王朝，字裡行間充滿著不惜以改變政體來振興國家的想法。
當然，李鴻章沒作答也沒接見，但確實是一篇使他難以忘懷的文章。究竟是個什麼樣的人物呢？沒把他找來見見，李鴻章不禁有些後悔了。持這種想法的青年似乎在漸漸增多，當權者不採納他們的政治主張，他們就可能糾合抱有同一志向的人，聚眾結黨。到那時，就可能會出現第二個太平天國。日軍進攻北京，正好給他們以良機……
4月13日，李鴻章又向總理衙門請示，可否在伊藤提出的修正案上簽字蓋章。
日方向中方代表施加壓力：如果和談趨於破裂，停戰協議就自動失效，戰局重開。
4月14日，星期日，中方代表沒有休息。四天的期限，明天截止。李鴻章給天津海關的道員盛宣懷發了一封電報。往常李鴻章從下關往本國發電報都是給總理衙門，這次致電海關道員，是答覆三天前天津海關稅務司德璀琳，以示繼續聯絡。至於盛宣懷，是李鴻章的得力部下。當李鴻章在天津時，盛宣懷幾乎就是北洋派支撐門戶的元老。電文是：「伊藤兩次哀的美敦書（最後通牒），雲無可商改。現約明日會晤即定。欲保京城，不得不爾，以後看各國辦法。朝鮮準自主，商令兩國勿干預內治，伊不允，非據而何？」
他似乎把憤怒都傾瀉在電報中了。
北京也無可奈何，只好如此了。
翁同龢的日記中，14日這天寫道：「不欲記，不忍記也。」當然是指下關來電的絕望情況。
4月15日的會談預定在下午四點開始，14日夜裡和15日午後，北京以皇帝名義先後兩次向下關發來准予簽約的電報，大概是怕誤事，發生不虞，所以才反覆發電報——
「李鴻章十九日三電均悉。十八日所諭各節，原冀爭得一分有一分之益，如竟無可商改，即遵前旨與之定約。欽此。」
李鴻章於三月十九日（陽曆4月13日）發了三封電報。據說，中方代表團在下關期間花了一萬五千元的電報費。
「若不如此，北京恐將不保。」這句話把宮廷的強硬派也都嚇得不做聲了。究竟誰來保衛北京呢？只憑悲憤慷慨是不能阻止敵兵入侵的，強硬派的本質早已從吳大澂的敗戰中暴露無遺。
李鴻章在赴日和談之前，曾拜會首席軍機大臣恭親王，提出：「如談判破裂，請立刻將主上遷至西安，一定把主戰派留在北京，讓他們同日軍作戰。這件事可在眾人面前提議，主戰派逃離北京者，一律問斬。」
於是，在重臣會議上，恭親王說：假如議和破裂，主戰派大臣都應以紫禁城為據點，血戰到底。說也奇怪，自從恭親王說了這話之後，主戰派的調子確實不那麼高了。
當然，這樣做是為了給媾和簽約鋪平道路。李鴻章和恭親王的互相配合，在宮廷裡收到了顯著的效果。
清政府代表團的氣氛比當初緩和多了。李鴻章遭暴徒狙擊一事，使一般日本人對代表團的態度發生了很大變化。
慰問品源源不斷地送來，其中有皇后製作的繃帶。下關西部的漁民送來玻璃魚缸，裡面裝著七十多條活魚。甚至有些日本人還做出贖罪舉動。
當然，說穿了，這並不是惋惜李鴻章的遇難，而是行刺事件使日本受到世界各國的譴責，他們害怕對媾和不利。對此，陸奧在他的《蹇蹇錄》中也有所記載。
清政府代表團近來感到日本人的敵意緩和了，心理上的壓力減輕了許多。而且，國內對於代表團據理力爭的情況也有所瞭解。過去指責李鴻章是賣國賊的罵聲，由於李鴻章的遇刺而逐漸消斂。強硬派的攻擊之詞喪失了說服力。
接到皇上批准簽約的電報，住在引接寺的清政府代表團成員們頓時都如釋重負，若不因為是處理戰敗媾和，必須謹慎從事，真想舉杯慶賀一下。
「簽了條約……就馬上……回國！」李鴻章把電文放回桌上，摘下眼鏡，斷斷續續地說道。
「我的事情可算辦完了！」李鴻章獨自喃喃地說道。
4月15日第五次會談（加上在病床上的那一次為第六次）之後，七十三歲高齡的李鴻章覺得疲勞不堪了。
那一天，他拼出最後一點力量，要求把二億兩賠款再減少五千萬，為一億五千萬兩。
「這個問題不能再談了，已經減少了三分之一嘛！」
伊藤不想再談下去。
「那就再減少兩千萬兩吧。」
然而，伊藤一個勁兒搖頭。
賠款當然是用清政府的單位來表示。清政府是銀本位，但沒有貨幣。有一種洋銀在市面上流通，是以墨西哥銀元為主的外國銀幣。還有一種馬蹄銀，是小銀塊。按純銀稱量，純銀五百七十五格令（約三十七克）為一兩，叫庫平兩。所謂「庫平」，是保管在戶部的標準秤。
戰爭之前，光緒十七年（1891年）歲入為八千九百六十八萬餘兩，歲出為七千九百三十五萬餘兩（據《清史稿·食貨志》）。由此可見，日本的要求對於清政府來說是多麼苛刻。
伊藤首相同意把作為條約擔保的佔領威海衛和奉天兩地改為只佔領威海衛，清廷支付駐兵費由年二百萬兩減為五十萬兩。
4月10日和15日兩次會談，日方委員陸奧外相因病未出席。
簽字儀式在4月17日舉行，這天正好是甲午日。戰爭爆發之年的1894年是甲午年，所以中國一般把這次戰爭稱做「甲午戰爭」。甲午之年爆發的戰爭，於次年三月的甲午之日收場——簽署媾和條約。
簽字儀式只不過是一種形式，陸奧外相也抱病出席。
再沒有可議的問題了，這一天，他們只談些非正式的閒話。作為正式的國家代表，為結束戰爭的和談而來，因此，儘管李鴻章在十年前締結《天津條約》時就認識了伊藤博文，也必須避免議題以外的閒談。在談判中，有時似乎也談些閒話，但雙方都明白，醉翁之意不在酒，並非純粹的閒談。
簽署已畢，不管再談什麼，條約也不能變更了，於是，兩國代表第一回東拉西扯起來。